RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366959.4

RPS6KC1-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene RPS6KC1, Length 5,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-201ENST00000366959 TBXA2RP21731 343 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 LINC00303Q3SY05 128 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR4C16Q8NGL9 310 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR10J5Q8NHC4 309 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 JAM3Q9BX67 310 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 ATG2BQ96BY7 2078 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 TJP1Q07157 1748 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 A0A087WV62 115 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 SLC17A1Q14916 467 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 Q6ZRG5 221 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 SSX9Q7RTT3 188 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 ISYNA1Q9NPH2 558 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 DCTN6O00399 190 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 XRCC3O43542 346 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR2F2O95006 317 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 EMP3P54852 163 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 CD300CQ08708 224 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR2F1Q13607 317 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 IL34Q6ZMJ4 242 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 MAMSTRQ6ZN01 415 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 RAB39BQ96DA2 213 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 HIPK2Q9H2X6 1198 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 GPR160Q9UJ42 338 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 CLEC12BQ2HXU8 276 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 BHLHA9Q7RTU4 235 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCDC190Q86UF4 302 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 MAGT1Q9H0U3 335 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 CRLF2Q9HC73 371 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 SERGEFQ9UGK8 458 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 ACKR3P25106 362 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 KIAA0040Q15053 153 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 SPANXN5Q5MJ07 72 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR2L13Q8N349 312 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 SLC38A9Q8NBW4 561 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR4S1Q8NGB4 309 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
RPS6KC1-201ENST00000366959 XRCC2O43543 280 aa12.96□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR2J2O76002 312 aa12.96□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 PSMB3P49720 205 aa12.96□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 LAT2Q9GZY6 243 aa12.96□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa12.96□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 MAST2Q6P0Q8 1798 aa12.96□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 ADRB1P08588 477 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 GABRA4P48169 554 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 WNT3P56703 355 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR11L1Q8NGX0 322 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 HMGCLL1Q8TB92 370 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 EID2BQ96D98 161 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 RD3LP0DJH9 198 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 MLF1P58340 268 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 AK3Q9UIJ7 227 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 ARRDC5A6NEK1 342 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 AQP7O14520 342 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 CXCL13O43927 109 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 EMC4Q5J8M3 183 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 Q6ZS52 159 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 CAPZBP47756 277 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 FXNQ16595 210 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR52N5Q8NH56 324 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 TVP23CQ96ET8 276 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 ADAM19Q9H013 955 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 FBXO4Q9UKT5 387 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 SPINT2O43291 252 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 DFFBO76075 338 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 DUSP1P28562 367 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 GPNMBQ14956 572 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 C9orf50Q5SZB4 431 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 TMEM268Q5VZI3 342 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 NECAP1Q8NC96 275 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 APH1BQ8WW43 257 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 NRTNQ99748 197 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 PBOV1Q9GZY1 135 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 DEFB127Q9H1M4 99 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 C20orf141Q9NUB4 165 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 SLC23A1Q9UHI7 598 aa12.95□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa12.94□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 SHISA8B8ZZ34 492 aa12.94□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 UMAD1C9J7I0 102 aa12.94□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 H7C1Q1 480 aa12.94□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa12.94□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 PRPH2P23942 346 aa12.94□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 RPL12P30050 165 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 KIR2DS4P43632 304 aa12.94□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 RAE1P78406 368 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 KIR2DS1Q14954 304 aa12.94□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 TFAP2EQ6VUC0 442 aa12.94□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF793Q6ZN11 406 aa12.94□□□□□ -0.34
RPS6KC1-201ENST00000366959 MFSD4AQ8N468 514 aa12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms