RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF627Q7L945 461 aa16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 ASB13Q8WXK3 278 aa16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 MR1Q95460 341 aa16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 TGIF2Q9GZN2 237 aa16.72■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 NPIPB13A6NJU9 1138 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 NPIPB4C9JG80 1138 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 HOXA6P31267 233 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 DNASE1L1P49184 302 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 RPS18P62269 152 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 C17orf67Q0P5P2 114 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 OR7A5Q15622 319 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 C1orf100Q5SVJ3 147 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 PRAMEF20Q5VT98 475 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 DNM1P34Q6PK57 102 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 DEGS2Q6QHC5 323 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC00346Q8IVM7 164 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A0A6YYH2 397 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 A6NJ64 397 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 A8MXK9 166 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 NPIPA5E9PKD4 350 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 H3BML4 177 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 DAP3P51398 398 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 SPOCK1Q08629 439 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 TUSC1Q2TAM9 212 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 GSG1LQ6UXU4 331 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 RABEPKQ7Z6M1 372 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 CDH26Q8IXH8 852 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 OR10G3Q8NGC4 313 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 COQ8AQ8NI60 647 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 CMKLR1Q99788 373 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 FXYD6Q9H0Q3 95 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 NPIPA1Q9UND3 350 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 EML6Q6ZMW3 1958 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP1-201ENST00000357436 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa16.71■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 LMX1BO60663 402 aa16.71■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 RAB3DO95716 219 aa16.71■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 GMFBP60983 142 aa16.71■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 C4orf46Q504U0 113 aa16.71■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 NAT6Q93015 286 aa16.71■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 POTEKPQ9BYX7 375 aa16.71■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 SHARPINQ9H0F6 387 aa16.71■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 POFUT1Q9H488 388 aa16.71■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM138Q9NPI0 162 aa16.71■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 OVCH2Q7RTZ1 564 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 GALNT16Q8N428 558 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 JAGN1Q8N5M9 183 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC39A7Q92504 469 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 PTX4Q96A99 478 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 GAL3ST1Q99999 423 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 UPB1Q9UBR1 384 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 PMPCAQ10713 525 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 MOGAT2Q3SYC2 334 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM244Q5VVB8 128 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 RHBDD1Q8TEB9 315 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 SESN1Q9Y6P5 492 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 H3BUI4 141 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 PMS2P2O95744 297 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF735P0CB33 412 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 HSF1Q00613 529 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 SQSTM1Q13501 440 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 OR10K2Q6IF99 312 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF133Q8WVZ7 376 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 CHST11Q9NPF2 352 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 MED29Q9NX70 200 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 KRBOX1C9JBD0 128 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 M0QYG6 137 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 RPA2P15927 270 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 PNLIPP16233 465 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 MMP16P51512 607 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 TLE3Q04726 772 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 NKAIN3Q8N8D7 197 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 DTWD2Q8NBA8 298 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 OR4D6Q8NGJ1 314 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 OR6K3Q8NGY3 331 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC107Q8WV48 283 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 KLRF1Q9NZS2 232 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-201ENST00000357436 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms