RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 GJC3Q8NFK1 279 aa15.75■□□□□ 0.11
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ACTB-201ENST00000331789 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
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ACTB-201ENST00000331789 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa15.74■□□□□ 0.11
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ACTB-201ENST00000331789 HIST2H3AQ71DI3 136 aa15.74■□□□□ 0.11
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ACTB-201ENST00000331789 CTSSP25774 331 aa15.73■□□□□ 0.11
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ACTB-201ENST00000331789 SLC10A1Q14973 349 aa15.73■□□□□ 0.11
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ACTB-201ENST00000331789 RNF121Q9H920 327 aa15.72■□□□□ 0.11
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ACTB-201ENST00000331789 CACNG2Q9Y698 323 aa15.72■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 MUC6Q6W4X9 2439 aa15.71■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa15.71■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa15.71■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 MEIOCA2RUB1 952 aa15.71■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 MEGF11A6BM72 1044 aa15.71■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 IGHV3-9P01782 118 aa15.71■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 HTR2CP28335 458 aa15.71■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 DDOSTP39656 456 aa15.71■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 TNFSF10P50591 281 aa15.71■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 AGAP6Q5VW22 663 aa15.71■□□□□ 0.11
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