RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 CD79AP11912 226 aa22.6■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 PSMB6P28072 239 aa22.6■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 TNFRSF4P43489 277 aa22.6■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 RAB11FIP2Q7L804 512 aa22.6■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 TSLPQ969D9 159 aa22.6■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 TREM1Q9NP99 234 aa22.6■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 OR52A1Q9UKL2 312 aa22.6■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 R4GMQ9 66 aa22.6■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 MST1LQ2TV78 715 aa22.59■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 C1orf100Q5SVJ3 147 aa22.59■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 FGGYQ96C11 551 aa22.59■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 F8VVB4 439 aa22.59■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 F8VWA3 439 aa22.59■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 SPP1P10451 314 aa22.59■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 NKAPLQ5M9Q1 402 aa22.59■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 DCXRQ7Z4W1 244 aa22.59■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 OR10R2Q8NGX6 335 aa22.59■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 FOXQ1Q9C009 403 aa22.59■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa22.58■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 SSX5O60225 188 aa22.58■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 CA3P07451 260 aa22.58■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 NICN1Q9BSH3 213 aa22.58■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 LAT2Q9GZY6 243 aa22.58■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SENP3-201ENST00000321337 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa22.58■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 B4DGG1 531 aa22.58■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 ADAP1O75689 374 aa22.58■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 DCDP81605 110 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 BAP18Q8IXM2 172 aa22.58■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 SPACA5Q96QH8 159 aa22.58■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 TMEM100Q9NV29 134 aa22.58■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 FAM221BA6H8Z2 402 aa22.57■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 TNFP01375 233 aa22.57■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 FAM157CP0CG43 387 aa22.57■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 PI3P19957 117 aa22.57■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 SGCBQ16585 318 aa22.57■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 TXNIPQ9H3M7 391 aa22.57■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 LRP4O75096 1905 aa22.57■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa22.57■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 CRYBA1P05813 215 aa22.57■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 RFC3P40938 356 aa22.57■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 CBX5P45973 191 aa22.57■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 C10orf91Q5T1B1 145 aa22.57■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 ZDHHC22Q8N966 263 aa22.57■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 STOML3Q8TAV4 291 aa22.57■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 ACKR4Q9NPB9 350 aa22.57■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa22.57■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 DBX1A6NMT0 343 aa22.56■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 NSA2O95478 260 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 VSIG8P0DPA2 414 aa22.56■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 TPT1P13693 172 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 GPR119Q8TDV5 335 aa22.56■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 CENPMQ9NSP4 180 aa22.56■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 CTSFQ9UBX1 484 aa22.56■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 H0YIG0 161 aa22.56■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 ZNF217O75362 1048 aa22.56■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 GNALP38405 381 aa22.56■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 HSD17B7P56937 341 aa22.56■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 PHF19Q5T6S3 580 aa22.56■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 SLC30A7Q8NEW0 376 aa22.56■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 ARL11Q969Q4 196 aa22.56■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa22.56■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 OR5AC2Q9NZP5 309 aa22.56■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 LAMA1P25391 3075 aa22.55■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 EFNA3P52797 238 aa22.55■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 TMEM92Q6UXU6 159 aa22.55■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 RXFP4Q8TDU9 374 aa22.55■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 OR2S2Q9NQN1 319 aa22.55■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 RAB22AQ9UL26 194 aa22.55■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 A0A0A6YYH2 397 aa22.55■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 MEGF11A6BM72 1044 aa22.55■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 METTL21EPA6NDL7 271 aa22.55■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 A6NJ64 397 aa22.55■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 FARS2O95363 451 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 QRFPP83859 136 aa22.55■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 SLC9A3R2Q15599 337 aa22.55■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 MICBQ29980 383 aa22.55■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 HRH4Q9H3N8 390 aa22.55■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 UQCC1Q9NVA1 299 aa22.55■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 ST7LQ8TDW4 575 aa22.54■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 ADIPOR1Q96A54 375 aa22.54■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 PLPP3O14495 311 aa22.54■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 CD1CP29017 333 aa22.54■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 OR1D4P47884 311 aa22.54■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SENP3-201ENST00000321337 SEC16AO15027 2179 aa22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms