RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 DPAGT1Q9H3H5 408 aa15.01□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 DIABLOQ9NR28 239 aa15.01□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 ZNF716A6NP11 495 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 XRCC3O43542 346 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 CTSSP25774 331 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 HTR2CP28335 458 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 GDNFP39905 211 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 CX3CR1P49238 355 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 CAPZA1P52907 286 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 TAS2R20P59543 309 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 AP3S2P59780 193 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 BTG1P62324 171 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 FOXC1Q12948 553 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 C2orf76Q3KRA6 126 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 PLA1AQ53H76 456 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 ANKRD16Q6P6B7 361 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 IGF2-ASQ6U949 168 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 ZNF283Q8N7M2 679 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 ROBO4Q8WZ75 1007 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 SLC39A7Q92504 469 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 NABP1Q96AH0 204 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 UPRTQ96BW1 309 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 FGGYQ96C11 551 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 AUNIPQ9H7T9 357 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 ASCL3Q9NQ33 180 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 PLA2G3Q9NZ20 509 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 ACOT7O00154 380 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 GLSO94925 669 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 GSTT2BP0CG30 244 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 TATDN3Q17R31 274 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 AAED1Q7RTV5 226 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 OR52I2Q8NH67 350 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 UBASH3BQ8TF42 649 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 PHF21AQ96BD5 680 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 COPZ2Q9P299 210 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 ZNF221Q9UK13 617 aa15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 CYTIPO60759 359 aa14.99□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 BDKRB2P30411 391 aa14.99□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 GNALP38405 381 aa14.99□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 DDOSTP39656 456 aa14.99□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 HIST1H3AP68431 136 aa14.99□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 PLGLB1Q02325 96 aa14.99□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 SPOCK1Q08629 439 aa14.99□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 TGIF1Q15583 401 aa14.99□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 C1orf100Q5SVJ3 147 aa14.99□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.99□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa14.99□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 SLC25A25Q6KCM7 469 aa14.99□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 HIST2H3AQ71DI3 136 aa14.99□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 GALNT16Q8N428 558 aa14.99□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 OR8B12Q8NGG6 310 aa14.99□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 OR5D14Q8NGL3 314 aa14.99□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 SLC25A28Q96A46 364 aa14.99□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 HES7Q9BYE0 225 aa14.99□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 TTTY12Q9BZ98 90 aa14.99□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa14.99□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 CACNA1CQ13936 2221 aa14.98□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 A0A0B4J293 547 aa14.98□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 A0A1B0GTI1 187 aa14.98□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa14.98□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 LMX1BO60663 402 aa14.98□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 CTAG2O75638 210 aa14.98□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 SP1P08047 785 aa14.98□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 ZNF20P17024 532 aa14.98□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 BTCP35070 178 aa14.98□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 RRADP55042 308 aa14.98□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 CLDN15P56746 228 aa14.98□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 FAM27BQ5VT28 67 aa14.98□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 GPR137CQ8N3F9 429 aa14.98□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 JAGN1Q8N5M9 183 aa14.98□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 OR1M1Q8NGA1 313 aa14.98□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 OR51A2Q8NGJ7 313 aa14.98□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 OR6F1Q8NGZ6 308 aa14.98□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 OR51E1Q8TCB6 317 aa14.98□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 SORCS2Q96PQ0 1159 aa14.98□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa14.98□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 ALG5Q9Y673 324 aa14.98□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 PTPRBP23467 1997 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 OR5H15A6NDH6 313 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 NAP1L6A6NFF2 107 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 NME2P1O60361 137 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 APOC1P02654 83 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 LIPCP11150 499 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 ARSBP15848 533 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 SPINK2P20155 84 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 NME2P22392 152 aa14.97□□□□□ -0.01
SSR4-201ENST00000320857 PLA2G7Q13093 441 aa14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms