RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308580.11

TMOD3-201, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD3, Length 8,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-201ENST00000308580 CNR1P21554 472 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 THSD4Q6ZMP0 1018 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 TMEM200AQ86VY9 491 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 UBALD2Q8IYN6 164 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 OR51A2Q8NGJ7 313 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 SMIM4Q8WVI0 70 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 MALSU1Q96EH3 234 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 CT62P0C5K7 136 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 FOLR1P15328 257 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 F2RL1P55085 397 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 CLN3Q13286 438 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 ZIC1Q15915 447 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 OR51A4Q8NGJ6 313 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 PELI1Q96FA3 418 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 OR8B4Q96RC9 309 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 GABRG3Q99928 467 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 BARHL1Q9BZE3 327 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 FBXL4Q9UKA2 621 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 TRIM64BA6NI03 449 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 TOR1AO14656 332 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 ARPC3O15145 178 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 B4GALT1P15291 398 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 KIR2DS4P43632 304 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 KIR2DS1Q14954 304 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 RDH5Q92781 318 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 CDC42EP2O14613 210 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 ATF1P18846 271 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 RFX2P48378 723 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 DPPA2Q7Z7J5 298 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 WDSUB1Q8N9V3 476 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 OR8D4Q8NGM9 314 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 OTOSQ8NHW6 89 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 SCARB1Q8WTV0 552 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 C11orf40Q8WZ69 217 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa8.95□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 DEGS1O15121 323 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 GNB3P16520 340 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 CRYBB2P43320 205 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 GZMKP49863 264 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 C21orf58P58505 322 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 SLC38A9Q8NBW4 561 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 CDAP32320 146 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 ARL3P36405 182 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 SPRED2Q7Z698 418 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 APH1BQ8WW43 257 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 SERTAD4Q9NUC0 356 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 B3GAT1Q9P2W7 334 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 ANKUB1A6NFN9 424 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 TPPPO94811 219 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 PRKACAP17612 351 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 ECI1P42126 302 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 HBG1P69891 147 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 HBG2P69892 147 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 LAIR1Q6GTX8 287 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 GUSBP11Q6P575 273 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 PLXDC2Q6UX71 529 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 OR52H1Q8NGJ2 320 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 ROBO4Q8WZ75 1007 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 NGBQ9NPG2 151 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 HSD17B6O14756 317 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 KITLGP21583 273 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 RPS10P46783 165 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 SLC10A1Q14973 349 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 CBLN3Q6UW01 205 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 ZADH2Q8N4Q0 377 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 OR6K3Q8NGY3 331 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 UFSP2Q9NUQ7 469 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 ATG2BQ96BY7 2078 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 OR6C68A6NDL8 312 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 NRASP01111 189 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 CADM4Q8NFZ8 388 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 CYSLTR2Q9NS75 346 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 DLEC1Q9Y238 1755 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 C5orf49A4QMS7 147 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 TNFSF11O14788 317 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 MOSPD3O75425 235 aa8.94□□□□□ -0.98
TMOD3-201ENST00000308580 CBR3O75828 277 aa8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms