RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301021.7

TRAPPC2L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CDRT4Q8N9R6 151 aa16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PLPP7Q8NBV4 271 aa16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SCRT1Q9BWW7 348 aa16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 S1PR5Q9H228 398 aa16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SPTBP11277 2137 aa16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BTBD17A6NE02 478 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CXorf65A6NEN9 183 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 METAP1P53582 386 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RUNX3Q13761 415 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FHL5Q5TD97 284 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PARM1Q6UWI2 310 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BCO1Q9HAY6 547 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DOK5Q9P104 306 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 A0A087X0M5 115 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 A0A1B0GX30 115 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TBPP20226 339 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GJA4P35212 333 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HSD11B2P80365 405 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ODF4Q2M2E3 257 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WDR38Q5JTN6 314 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MTSS1LQ765P7 747 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PPP1R3BQ86XI6 285 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TCTN2Q96GX1 697 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C20orf24Q9BUV8 137 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RAB33BQ9H082 229 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WDR76Q9H967 626 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CA14Q9ULX7 337 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa16■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UMAD1C9J7I0 102 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 H3BSH0 61 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TSPAN15O95858 294 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ALOX5APP20292 161 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ID4P47928 161 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LSSP48449 732 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RAB28P51157 221 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EBPQ15125 230 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GUK1Q16774 197 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HYAL4Q2M3T9 481 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MOGAT2Q3SYC2 334 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ACTBL2Q562R1 376 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMEM128Q5BJH2 165 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GLYATL3Q5SZD4 288 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TDHQ8IZJ6 230 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UBAC2Q8NBM4 344 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FGF14Q92915 247 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NUDT9Q9BW91 350 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMED3Q9Y3Q3 217 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 F10P00742 488 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CEACAM6P40199 344 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BTN3A2P78410 334 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMEM225Q6GV28 225 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FJX1Q86VR8 437 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OR10D4PQ8NGN7 298 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MAFIPQ8WZ33 124 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ROBO4Q8WZ75 1007 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UBQLN4Q9NRR5 601 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CKLFQ9UBR5 152 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KCNK6Q9Y257 313 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SZT2Q5T011 3432 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FITM1A5D6W6 292 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SLC35G4P0C7Q5 338 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C6P13671 934 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FSTP19883 344 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C5AR1P21730 350 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NDUFA6P56556 154 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RPS23P62266 143 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RAP1AP62834 184 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RSU1Q15404 277 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF260Q3ZCT1 412 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MDGA2Q7Z553 956 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HOGA1Q86XE5 327 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 YAF2Q8IY57 180 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BHLHE23Q8NDY6 225 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GPBAR1Q8TDU6 330 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GALNT14Q96FL9 552 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TSSK2Q96PF2 358 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 A0A087WV62 115 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 JTBO76095 146 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OR2C1O95371 312 aa15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GPANK1O95872 356 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms