RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283290.9

ATG3-201, Transcript of autophagy related 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3-201ENST00000283290 PPP1CBP62140 327 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 GGTLC2Q14390 218 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 APOL4Q9BPW4 351 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 C8orf4Q9NR00 106 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 SPEF1Q9Y4P9 236 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 ITPR3Q14573 2671 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 ZNF878C9JN71 531 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 M0R135 149 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 GLRXP35754 106 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 ATP6V1E1P36543 226 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 ALDH3B1P43353 468 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 ZNF91Q05481 1191 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 OCLNQ16625 522 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 SNAI3Q3KNW1 292 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 TTC23Q5W5X9 447 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 C11orf71Q6IPW1 123 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 ZNF283Q8N7M2 679 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 OR10H4Q8NGA5 316 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 RNF133Q8WVZ7 376 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 PERPQ96FX8 193 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 ZNF799Q96GE5 643 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 CACNG6Q9BXT2 260 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 CXXC4Q9H2H0 198 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 CLN6Q9NWW5 311 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 CMAHPQ9Y471 501 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 LY6HO94772 140 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 LCATP04180 440 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 H2BFMP0C1H6 154 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 OPRL1P41146 370 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 RAD52P43351 418 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 MTNR1AP48039 350 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 CX3CR1P49238 355 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 ZNF544Q6NX49 715 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 DTX2Q86UW9 622 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 OR2AE1Q8NHA4 323 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 TFAP2CQ92754 450 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 YIPF3Q9GZM5 350 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 PLK3Q9H4B4 646 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 ZNF442Q9H7R0 627 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 CBLN4Q9NTU7 201 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 FAIMQ9NVQ4 179 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 LRP12Q9Y561 859 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 ADRA2AP08913 450 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 DBTP11182 482 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 HSD11B1P28845 292 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 PCSK6P29122 969 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 ISL1P61371 349 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 AGAP6Q5VW22 663 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 LAIR2Q6ISS4 152 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 KRT77Q7Z794 578 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 RFKQ969G6 155 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 LGALS12Q96DT0 336 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 KCNJ15Q99712 375 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 HAO2Q9NYQ3 351 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 IKZF2Q9UKS7 526 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 MYRFQ9Y2G1 1151 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 OVOL3O00110 214 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 RBMXP38159 391 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 PTH2RP49190 550 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 TPTEP56180 551 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 SWI5Q1ZZU3 235 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 GFOD2Q3B7J2 385 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 SLC25A30Q5SVS4 291 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 SPTSSAQ969W0 71 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 PPP1R14AQ96A00 147 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 BCL2L14Q9BZR8 327 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 TPK1Q9H3S4 243 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 CXorf56Q9H5V9 222 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 ELOVL3Q9HB03 270 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 ZNF319Q9P2F9 582 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 A0A1W2PPW3 197 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 TBX1O43435 398 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 NAT2P11245 290 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 ZNF85Q03923 595 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 ECH1Q13011 328 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 USP51Q70EK9 711 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 FAM57BQ71RH2 274 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG3-201ENST00000283290 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.7 ms