RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 RASL12Q9NYN1 266 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 SSUH2Q9Y2M2 353 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 APC2O95996 2303 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 MPDZO75970 2070 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 UBE2QL1A1L167 161 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 J3QLW9 94 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF19P17023 458 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 CNR1P21554 472 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 EGR4Q05215 589 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 FOXF1Q12946 379 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 MFAP5Q13361 173 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 OR52L1Q8NGH7 329 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 GNRHR2Q96P88 292 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 BHLHE40O14503 412 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 PLPP2O43688 288 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 SLC25A12O75746 678 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 KRT33AO76009 404 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 MT-ND5P03915 603 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 S100A9P06702 114 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 PLA2G5P39877 138 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 SORDQ00796 357 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 DCAF12L2Q5VW00 463 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 OR1J4Q8NGS1 313 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 C4orf36Q96KX1 117 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 NIT2Q9NQR4 276 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 KLHL9Q9P2J3 617 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 FBXL3Q9UKT7 428 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 SHISA8B8ZZ34 492 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 IL5P05113 134 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 CRYBA1P05813 215 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 CLUP10909 449 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 CXCR1P25024 350 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 ART1P52961 327 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 CORO6Q6QEF8 472 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 SPACA3Q8IXA5 215 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 LILRB2Q8N423 598 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 ORAI1Q96D31 301 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF251Q9BRH9 671 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 HES7Q9BYE0 225 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 TTTY10Q9BZA0 68 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 DKK4Q9UBT3 224 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 TMED7Q9Y3B3 224 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 PTHLHP12272 177 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 BMP7P18075 431 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 OR12D2P58182 307 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 TRAM1Q15629 374 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 UBE2NLQ5JXB2 153 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 SLC6A19Q695T7 634 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 THSD4Q6ZMP0 1018 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 SPAG16Q8N0X2 631 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 PTGES2Q9H7Z7 377 aa18.11■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM72A0PK05 275 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 OR5H15A6NDH6 313 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 NOS3P29474 1203 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 DCTDP32321 178 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 EIF1P41567 113 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 C11orf88Q6PI97 169 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 GHSRQ92847 366 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 TEAD3Q99594 435 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 PLEKHA1Q9HB21 404 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 PINLYPA6NC86 204 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC3CA6NJW4 275 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 GABARAPH6UMI1 98 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 UBBP0CG47 229 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 VSIG10L2P0DP72 767 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 UBA52P62987 128 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 SLC25A53Q5H9E4 307 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 AVPI1Q5T686 147 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 MOB3CQ70IA8 216 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 CDK20Q8IZL9 346 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 CYB561A3Q8NBI2 242 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 MDS2Q8NDY4 140 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 THAP6Q8TBB0 222 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 POC1BQ8TC44 478 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 FCAMRQ8WWV6 532 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 PTDSS2Q9BVG9 487 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 LHX6Q9UPM6 363 aa18.1■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM218A2RU14 115 aa18.09■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 SC5DO75845 299 aa18.09■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 AKR7A3O95154 331 aa18.09■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
UBE2B-201ENST00000265339 FOXK1P85037 733 aa18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms