RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000054666.10

VAMP3-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP3, Length 2,205 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3-201ENST00000054666 DNPH1O43598 174 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 LMX1BO60663 402 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 SCGNO76038 276 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 KLK2P20151 261 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 RAB6AP20340 208 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 SRD5A2P31213 254 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 CX3CR1P49238 355 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 CLDN6P56747 220 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 TAS2R19P59542 299 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 LSM6P62312 80 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 PMPCAQ10713 525 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 CHAF1BQ13112 559 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 SSPNQ14714 243 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 SGCAQ16586 387 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF528Q3MIS6 628 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 RAB12Q6IQ22 244 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 ESX1Q8N693 406 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 ZBTB44Q8NCP5 570 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 OR9K2Q8NGE7 335 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 OR13C9Q8NGT0 318 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 OR14L1PQ8NHC6 308 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 OR51E1Q8TCB6 317 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 TAAR9Q96RI9 348 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 GAL3ST1Q99999 423 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 UQCC2Q9BRT2 126 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 DDA1Q9BW61 102 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 NELFAQ9H3P2 528 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 PROK2Q9HC23 129 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF69Q9UC07 566 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 MEIS3P1A6NDR6 274 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 TNFSF11O14788 317 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 RER1O15258 196 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 BPNT1O95861 308 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 WDPCPO95876 746 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 CYB5AP00167 134 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 SP9P0CG40 484 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 CXCL3P19876 107 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF84P51523 738 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 H3F3AP84243 136 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 GUCA2AQ02747 115 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 MFAP5Q13361 173 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 C10orf128Q5T292 105 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 CREB3L2Q70SY1 520 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 PGAP1Q75T13 922 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 OR8B12Q8NGG6 310 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 OR1J2Q8NGS2 313 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 GPX8Q8TED1 209 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 KCNE4Q8WWG9 221 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 FAM46BQ96A09 425 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 ULBP2Q9BZM5 246 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 B3GNT4Q9C0J1 378 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 UPB1Q9UBR1 384 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 RAB22AQ9UL26 194 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 MGAT4AQ9UM21 535 aa7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 LNP1A1A4G5 178 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 SNRPGP15A8MWD9 76 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 TNFRSF10AO00220 468 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 ZIC3O60481 467 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 ICMTO60725 284 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 RLN1P04808 185 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 IL5P05113 134 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 SERPINA7P05543 415 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 CD37P11049 281 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 SLC2A1P11166 492 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 CPN1P15169 458 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 DNASE1P24855 282 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 GFOD2Q3B7J2 385 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 AWAT2Q6E213 333 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 STEAP1BQ6NZ63 245 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF813Q6ZN06 617 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 DOK3Q7L591 496 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 C9orf62Q8N4C0 152 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 GJC3Q8NFK1 279 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 OR4D6Q8NGJ1 314 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 LILRB4Q8NHJ6 448 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 NKD1Q969G9 470 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 TMEM54Q969K7 222 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 MED30Q96HR3 178 aa7.31□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 PGAM5Q96HS1 289 aa7.31□□□□□ -1.24
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