RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 VBP1P61758 197 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TUBA1BP68363 451 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ST3GAL4Q11206 333 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TMED1Q13445 227 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 C1DQ13901 141 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.832e-10■■■■■ 40.3
CAPNS1-210ENST00000590211 LTB4RQ15722 352 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZSWIM7Q19AV6 140 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM44Q2T9K0 475 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM31Q5JXX7 168 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM236Q5W0B7 351 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 C12orf73Q69YU5 71 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ASPHD2Q6ICH7 369 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FRMPD2BQ6IN97 320 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 NIPAL1Q6NVV3 410 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 C1orf94Q6P1W5 598 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FRRS1Q6ZNA5 592 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 USP43Q70EL4 1123 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TUBA1AQ71U36 451 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 Q7L0L9 218 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PARGQ86W56 976 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 LACC1Q8IV20 430 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CDH26Q8IXH8 852 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CA13Q8N1Q1 262 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2L13Q8N349 312 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CSNK1A1LQ8N752 337 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MORN4Q8NDC4 146 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 B3GNT7Q8NFL0 401 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TSTD1Q8NFU3 115 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 KBTBD8Q8NFY9 601 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR7G2Q8NG99 324 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR4K5Q8NGD3 323 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR4D11Q8NGI4 311 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR6T1Q8NGN1 323 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR8J1Q8NGP2 316 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR13C3Q8NGS6 347 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR13C2Q8NGS9 318 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 OR52P1PQ8NH57 321 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PIGXQ8TBF5 258 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TEX47Q8TBZ9 253 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FNDC8Q8TC99 324 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC37A2Q8TED4 501 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PATE1Q8WXA2 126 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 GIMAP5Q96F15 307 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM80Q96HE8 168 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 FCRL4Q96PJ5 515 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 NEDD4LQ96PU5 975 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC38A2Q96QD8 506 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ARHGDIGQ99819 225 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR174Q9BXC1 333 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CDCA4Q9BXL8 241 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC38A1Q9H2H9 487 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 VCX2Q9H322 139 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PIGUQ9H490 435 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ARMC7Q9H6L4 198 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CALHM2Q9HA72 323 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC25A19Q9HC21 320 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 HRASLS2Q9NWW9 162 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR83Q9NYM4 423 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RDH8Q9NYR8 311 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 EPHA6Q9UF33 1036 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR45Q9Y484 360 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC22A7Q9Y694 548 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MTCH2Q9Y6C9 303 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 THADAQ6YHU6 1953 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ATRXP46100 2492 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1B0GVG6 124 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 XKRY2A2RUG3 117 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF860A6NHJ4 632 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 WASHC1A8K0Z3 465 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 SNURFLB1AK76 121 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 PROB1E7EW31 1015 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 M0R129 80 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 CCRL2O00421 344 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-210ENST00000590211 MYL12BO14950 172 aa3.62□□□□□ -1.83
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