RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, human

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM25-208	ENST00000574234	LGI1	O95970	557 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	LHB	P01229	141 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	IGHV2-70	P01814	119 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	IGHV4-59	P01825	116 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	LCAT	P04180	440 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF35	P13682	527 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	TUBA1B	P68363	451 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	TUBA4A	P68366	448 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	PDE7A	Q13946	482 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC17A1	Q14916	467 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	IFI44L	Q53G44	452 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	TUBA1A	Q71U36	451 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	SHF	Q7M4L6	423 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ST8SIA1	Q92185	356 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	CERS2	Q96G23	380 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	SAMD8	Q96LT4	415 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	DPH5	Q9H2P9	285 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	CDH20	Q9HBT6	801 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	CD274	Q9NZQ7	290 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	GPR132	Q9UNW8	380 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	CACNG2	Q9Y698	323 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234		H3BNH8	94 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	HSPA12A	O43301	675 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	PRAF2	O60831	178 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	KRT33A	O76009	404 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	KCNK2	O95069	426 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	MT-ATP6	P00846	226 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	IFNW1	P05000	195 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	SBK2	P0C263	348 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF250	P15622	560 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	CD1D	P15813	335 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	PGAM1	P18669	254 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	UQCRC2	P22695	453 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	BDKRB2	P30411	391 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	GABRA3	P34903	492 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	MAGEA4	P43358	317 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	KIR2DS4	P43632	304 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	MTCP1	P56278	107 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	TAS2R39	P59534	338 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	SELENOV	P59797	346 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ATP6V0D1	P61421	351 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	SNX1	Q13596	522 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	QPRT	Q15274	297 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	OR4D1	Q15615	310 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	TTMP	Q5BVD1	217 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	PEX26	Q7Z412	305 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	PIK3R3	Q92569	461 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	CCL17	Q92583	94 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	DPF1	Q92782	380 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	NEURL3	Q96EH8	262 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	NAT9	Q9BTE0	207 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	TRIM15	Q9C019	465 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234		Q9N2K0	584 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		4.2	□□□□□ -1.74

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