RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566708.1

PRMT7-222, Transcript of protein arginine methyltransferase 7, human

TSL 3

Gene PRMT7, Length 692 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT7-222	ENST00000566708	CCNI	Q14094	377 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	ASRGL1	Q7L266	308 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	ZNF786	Q8N393	782 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	COQ7	Q99807	217 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	TEX12	Q9BXU0	123 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	CMC2	Q9NRP2	79 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	CR1	P17927	2039 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	PLSCR5	A0PG75	271 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	C17orf100	A8MU93	164 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	ICMT	O60725	284 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	HMGN1	P05114	100 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	CLU	P10909	449 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	SPI1	P17947	270 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	TUBG1	P23258	451 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	GGT2	P36268	569 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	NR4A2	P43354	598 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	RGS6	P49758	472 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	CCL8	P80075	99 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	GGTLC2	Q14390	218 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	ATP6AP1	Q15904	470 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	ZNF511	Q8NB15	262 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	COG8	Q96MW5	612 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	MED20	Q9H944	212 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	DECR2	Q9NUI1	292 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	FAM183A	A6NL82	134 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708		F5H5K5	113 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708		G3V2T6	193 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708		H3BSA7	217 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	SPRY3	O43610	288 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	HPX	P02790	462 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	FCGR1A	P12314	374 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	COL8A2	P25067	703 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	MAGEB1	P43366	347 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	DAP	P51397	102 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	ZNF81	P51508	661 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	BLVRA	P53004	296 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	CDK5	Q00535	292 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	ECH1	Q13011	328 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	PSG7	Q13046	419 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	RDH5	Q92781	318 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	PTP4A1	Q93096	173 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	CMBL	Q96DG6	245 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	WDR76	Q9H967	626 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	VWC2L	B2RUY7	222 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	SPARC	P09486	303 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	ZNF23	P17027	643 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	LIPA	P38571	399 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	ENTPD1	P49961	510 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	CRISP1	P54107	249 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	TPTE	P56180	551 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	TAF13	Q15543	124 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
PRMT7-222	ENST00000566708	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms