RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564841.1

LINC00554-201, long intergenic non-protein coding RNA 554, humanhuman

BASIC

Gene LINC00554, Length 3,011 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00554-201ENST00000564841 AMDHD2Q9Y303 409 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00554-201ENST00000564841 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 DUXAA6NLW8 204 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 TNFRSF4P43489 277 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 PRSS35Q8N3Z0 413 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 CCDC54Q8NEL0 328 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 TCEAL7Q9BRU2 100 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 TREM2Q9NZC2 230 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 SLC22A13Q9Y226 551 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 ABCA7Q8IZY2 2146 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 PRSS38A1L453 326 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 DCDC2BA2VCK2 349 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 OR4C45A6NMZ5 311 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 H7C1Q1 480 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 PI3P19957 117 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 C1orf61Q13536 156 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 EBPQ15125 230 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 RNF44Q7L0R7 432 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 ZNF619Q8N2I2 560 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 ACBD4Q8NC06 268 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 ZNF563Q8TA94 476 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 RAB33BQ9H082 229 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 WDR76Q9H967 626 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 SDHAF3Q9NRP4 125 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 KLF15Q9UIH9 416 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 MPDZO75970 2070 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 A0A1B0GV50 99 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 RHPN2P1A8MT19 583 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 NDUFB2O95178 105 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 ENPP2Q13822 863 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 GGTLC2Q14390 218 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 EIPR1Q53HC9 387 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 FCRL6Q6DN72 434 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 IL34Q6ZMJ4 242 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 DPY19L4Q7Z388 723 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 OR2G2Q8NGZ5 317 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 LCN9Q8WX39 176 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 SYT4Q9H2B2 425 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 UFSP2Q9NUQ7 469 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 CYP8B1Q9UNU6 501 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 GMFGO60234 142 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 SLC34A2O95436 690 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 PMP2P02689 132 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 HSD17B2P37059 387 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 GSK3AP49840 483 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 RIDAP52758 137 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 STARD6P59095 220 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 ADAM8P78325 824 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 TDHQ8IZJ6 230 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 RAB42Q8N4Z0 105 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 COX18Q8N8Q8 333 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 RPS4Y2Q8TD47 263 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 TPSD1Q9BZJ3 242 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 SEC16AO15027 2179 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 A0A0B4J2E0 115 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 A0A1B0GX12 115 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 FAM157AC9JC47 383 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 MBTPS2O43462 519 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 PLGP00747 810 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 FCGR3AP08637 254 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 CPMP14384 443 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 RAB6AP20340 208 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 CASP6P55212 293 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 ACTBP60709 375 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 ACTG1P63261 375 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 ELOCQ15369 112 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 TMEM244Q5VVB8 128 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 FAM220AQ7Z4H9 259 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 OR2L5Q8NG80 312 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 A0A087WV62 115 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 RDH16O75452 317 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 CD1AP06126 327 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 CD5P06127 495 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 FAM53BQ14153 422 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 RAB11BQ15907 218 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 OR51A2Q8NGJ7 313 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 MITD1Q8WV92 249 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 OCSTAMPQ9BR26 566 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 P2RX6O15547 441 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 ITGA3P26006 1051 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 GABRA3P34903 492 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00554-201ENST00000564841 CLEC9AQ6UXN8 241 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.9 ms