RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	CORO6	Q6QEF8	472 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6ZR03	302 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	HAVCR1	Q96D42	359 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	COG8	Q96MW5	612 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	COQ7	Q99807	217 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	VNN3	Q9NY84	501 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	CLDN25	C9JDP6	229 aa		18.45	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	GGT2	P36268	569 aa		18.45	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	CENPA	P49450	140 aa		18.45	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	ERF	P50548	548 aa		18.45	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	MVK	Q03426	396 aa		18.45	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		18.45	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		18.45	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		18.45	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		18.45	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		18.45	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	PTP4A1	Q93096	173 aa		18.45	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM186	Q96B77	213 aa		18.45	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		18.45	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	C1orf21	Q9H246	121 aa		18.45	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	FN3K	Q9H479	309 aa		18.45	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		18.45	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		18.45	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	DYSF	O75923	2080 aa		18.45	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	MSMB	P08118	114 aa		18.44	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	RGS6	P49758	472 aa		18.44	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	18.44	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		18.44	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		18.44	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		18.44	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	CCL17	Q92583	94 aa		18.44	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	ASB9	Q96DX5	294 aa		18.44	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		18.44	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF212B	A8MTL3	300 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	CCNB2	O95067	398 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	RAC2	P15153	192 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	ACOT8	O14734	319 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	PCMT1	P22061	227 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	MICA	Q29983	383 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	PHC2	Q8IXK0	858 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2T29	Q8NH02	315 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	OR51F2	Q8NH61	342 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB1C	Q92928	201 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV2-5	P01817	119 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC36A3	Q495N2	470 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	LNX2	Q8N448	690 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	TIMD4	Q96H15	378 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200		U3KQV3	271 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	FBN3	Q75N90	2809 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC3A1	Q07837	685 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP6	Q96JE9	813 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	REEP1	Q9H902	201 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	ANK2	Q01484	3957 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	ACSM4	P0C7M7	580 aa		18.4	■□□□□ 0.54

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