RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 NTN4Q9HB63 628 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 FBXL3Q9UKT7 428 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 FZR1Q9UM11 496 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 AP4S1Q9Y587 144 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 LOC100509620A0A075B734 347 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 TMEM129A0AVI4 362 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 C5orf49A4QMS7 147 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 B9A039 149 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 H3BN98 237 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 SSX4O60224 188 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 TMCC2O75069 709 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 LY6HO94772 140 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 HLA-DQA2P01906 255 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 LCKP06239 509 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 EPHA1P21709 976 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 POU1F1P28069 291 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 CRABP1P29762 137 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 PYCR1P32322 319 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 ARHGDIAP52565 204 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 PCBD1P61457 104 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 ERVS71-1P61550 626 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 COX10Q12887 443 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 GK3PQ14409 553 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 TBC1D28Q2M2D7 210 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 SLC36A3Q495N2 470 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 FBLN7Q53RD9 439 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 AMIGO2Q86SJ2 522 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 LRP11Q86VZ4 500 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 SVOPLQ8N434 492 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 IQCF1Q8N6M8 205 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 NPEPL1Q8NDH3 523 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 ICA1LQ8NDH6 482 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 BVESQ8NE79 360 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 OR51L1Q8NGJ5 315 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 OR1J2Q8NGS2 313 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 ZNRF4Q8WWF5 429 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 DDOQ99489 341 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 PLK3Q9H4B4 646 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 ZNF442Q9H7R0 627 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 ZNF556Q9HAH1 456 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 DUSP13Q9UII6 198 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 CMAHPQ9Y471 501 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 RGS13O14921 159 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 RER1O15258 196 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 TFP02787 698 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 ANXA8P13928 327 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 GLRXP35754 106 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 RAD52P43351 418 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 GDI2P50395 445 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 UCP2P55851 309 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 LSM6P62312 80 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 TEKQ02763 1124 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 ALKBH6Q3KRA9 238 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 LCE4AQ5TA78 99 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 ACSM5Q6NUN0 579 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 DNM1P34Q6PK57 102 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 CORO6Q6QEF8 472 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 CD300LDQ6UXZ3 194 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 LNX2Q8N448 690 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 ATG16L2Q8NAA4 619 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 SLC37A3Q8NCC5 494 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 OR2T33Q8NG76 320 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 TEX47Q8TBZ9 253 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 LRTOMTQ8WZ04 291 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 POM121L2Q96KW2 1035 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 DOK1Q99704 481 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 SYT3Q9BQG1 590 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 SHARPINQ9H0F6 387 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 C1orf198Q9H425 327 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 ASH2LQ9UBL3 628 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 LPAR3Q9UBY5 353 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 POLR1DQ9Y2S0 133 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 FKBP7Q9Y680 259 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 DYSFO75923 2080 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 ARRDC5A6NEK1 342 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 TVP23AA6NH52 213 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 H7C417 338 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 SGCEO43556 437 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 DOK2O60496 412 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 SNAP29O95721 258 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 CLPTM1O96005 669 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 NGFP01138 241 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 GYPBP06028 91 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 ADRA2AP08913 450 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 GAAP10253 952 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 CLUP10909 449 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 OSMP13725 252 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 SRD5A1P18405 259 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-217ENST00000550044 FASP25445 335 aa8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.9 ms