RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 IFT27Q9BW83 186 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 CDH20Q9HBT6 801 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 TAS2R5Q9NYW4 299 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 IL20Q9NYY1 176 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 JKAMPQ9P055 326 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 MED31Q9Y3C7 131 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 A0A0G2JMP0 313 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 SLC1A7O00341 560 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 BET1O15155 118 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 SLITRK5O94991 958 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 PRSS23O95084 383 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 IFNW1P05000 195 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 GPX2P18283 190 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 ZNF404Q494X3 552 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 ESCO2Q56NI9 601 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 TIMM23BQ5SRD1 257 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 OR2T2Q6IF00 324 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 NOXA1Q86UR1 476 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 SGCDQ92629 289 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 MCHR2Q969V1 340 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 OR2M2Q96R28 347 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 TBX5Q99593 518 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 GPA33Q99795 319 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 A0A087WUU8 490 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 SERTM1A2A2V5 107 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 HTR2BP41595 481 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 GSTM5P46439 218 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 IL18R1Q13478 541 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 ADIPOQQ15848 244 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 COQ5Q5HYK3 327 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 CAMKMTQ7Z624 323 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 COMMD2Q86X83 199 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 OR2Z1Q8NG97 314 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 OR5J2Q8NH18 312 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 SGTBQ96EQ0 304 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 SLC38A2Q96QD8 506 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 OR5M11Q96RB7 305 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 ADAM19Q9H013 955 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 NUAK2Q9H093 628 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 USE1Q9NZ43 259 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 A0A0B4J2E0 115 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 A0A1B0GX12 115 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 A0A1W2PRG6 482 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 TRIM77I1YAP6 450 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 PLPP3O14495 311 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 CTDSP2O14595 271 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 XKRYO14609 159 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 FFAR1O14842 300 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 ABHD16AO95870 558 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 ALPLP05186 524 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 DANCRP0C864 163 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 IL7P13232 177 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 VBP1P61758 197 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 SEC23BQ15437 767 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 PODNL1Q6PEZ8 512 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 OR1K1Q8NGR3 316 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 SETD6Q8TBK2 473 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 SAMD8Q96LT4 415 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 OXGR1Q96P68 337 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 APOL4Q9BPW4 351 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 BCO1Q9HAY6 547 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 FAM118AQ9NWS6 357 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 GLTPQ9NZD2 209 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 A0A0X1KG70 313 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 A6NLC8 198 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 OR2T1O43869 369 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 TBX19O60806 448 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 SCG5P05408 212 aa6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83 ms