RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 LRP12Q9Y561 859 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 TMEM131Q92545 1883 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 MFNGO00587 321 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 FKTNO75072 461 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 IFNA6P05013 189 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 ACRP10323 421 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 VAMP1P23763 118 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 FCARP24071 287 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 CRABP1P29762 137 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 GDI1P31150 447 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 CCR4P51679 360 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 AKR1C2P52895 323 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 AKR1C1Q04828 323 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 ECH1Q13011 328 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 PRTGQ2VWP7 1150 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 GFOD2Q3B7J2 385 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 TMEM128Q5BJH2 165 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 VAX1Q5SQQ9 334 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 KCTD9Q7L273 389 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 CD163Q86VB7 1156 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 ARRDC1Q8N5I2 433 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 OR4S1Q8NGB4 309 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 TMED6Q8WW62 240 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 SELENOIQ9C0D9 397 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 TXNIPQ9H3M7 391 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 SEC61A2Q9H9S3 476 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 RHOFQ9HBH0 211 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 CLDN16Q9Y5I7 305 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 CACNA1AO00555 2505 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 DCDC2BA2VCK2 349 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 FITM1A5D6W6 292 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 POM121BA6NF01 834 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 COLCA2A8K830 154 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 H3BSH0 61 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 UBE2CO00762 179 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 SFT2D2O95562 160 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 CLPSP04118 112 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 CSN2P05814 226 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 LIPCP11150 499 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 PTAFRP25105 342 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 PMELP40967 661 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 TNFRSF4P43489 277 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 KCNJ3P48549 501 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 HSD17B7P56937 341 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 FAM189A2Q15884 450 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 NNATQ16517 81 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 MED25Q71SY5 747 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 SLC35D2Q76EJ3 337 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 RHOUQ7L0Q8 258 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 MDGA2Q7Z553 956 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 TMEM200AQ86VY9 491 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 ACBD4Q8NC06 268 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 OR51A2Q8NGJ7 313 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 CCL4L1Q8NHW4 92 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 ZNF563Q8TA94 476 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 CASTOR1Q8WTX7 329 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 OR5B2Q96R09 309 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 IL23AQ9NPF7 189 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 OR52A1Q9UKL2 312 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 KPTNQ9Y664 436 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 C2orf16Q68DN1 1984 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 WIPF3A6NGB9 483 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 MBTPS2O43462 519 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 FBXO24O75426 580 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 UTS2O95399 124 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 GPANK1O95872 356 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 CD5P06127 495 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 CHRM2P08172 466 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 CXCR1P25024 350 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 HRH1P35367 487 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 QRFPP83859 136 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 SPOCK1Q08629 439 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 OR7A5Q15622 319 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 SGCAQ16586 387 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 PCK2Q16822 640 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 ZNF585AQ6P3V2 769 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-202ENST00000542324 DNM1P34Q6PK57 102 aa9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms