RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532032.5

ATXN3-215, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATXN3, Length 1,191 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-215	ENST00000532032	GID4	Q8IVV7	300 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	SIAH3	Q8IW03	269 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	LCN9	Q8WX39	176 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	MOAP1	Q96BY2	351 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	RBP7	Q96R05	134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	FOXC2	Q99958	501 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	ABCG5	Q9H222	651 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	WDR54	Q9H977	334 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	CNIH4	Q9P003	139 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	RASD1	Q9Y272	281 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	NF1	P21359	2839 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	FEZF1	A0PJY2	475 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	LRIT2	A6NDA9	550 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	C2orf74	A8MZ97	194 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032		H3BMH7	237 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	BTN3A3	O00478	584 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	BHLHE40	O14503	412 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	CDC42EP2	O14613	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	BET1	O15155	118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	PGRMC2	O15173	223 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	CTDSPL	O15194	276 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	EMC8	O43402	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	PLPP2	O43688	288 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	PIP5K1C	O60331	668 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	UBL3	O95164	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	AIFM1	O95831	613 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	CH25H	O95992	272 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	MT-ND5	P03915	603 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	TCRB	P04435	133 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	SERPIND1	P05546	499 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	RRAS	P10301	218 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	PVR	P15151	417 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	UGT2B7	P16662	529 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	KLK2	P20151	261 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	TBXA2R	P21731	343 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	SLC2A5	P22732	501 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	MST1	P26927	711 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	NTS	P30990	170 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	TALDO1	P37837	337 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	GPR4	P46093	362 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	INPP1	P49441	399 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	MMP15	P51511	669 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67	5e-7	■■■■□ 25.1
ATXN3-215	ENST00000532032	ZNF136	P52737	540 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	FOXL2	P58012	376 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	OR10A3	P58181	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	HSF2	Q03933	536 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	PUDP	Q08623	228 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	ST3GAL3	Q11203	375 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	TRAM1	Q15629	374 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	CEBPE	Q15744	281 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	C3AR1	Q16581	482 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	AANAT	Q16613	207 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	CDC73	Q6P1J9	531 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	COMMD7	Q86VX2	200 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	VRK2	Q86Y07	508 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	NRM	Q8IXM6	262 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	TIGD4	Q8IY51	512 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	OR2T33	Q8NG76	320 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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