RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529919.5

CTNND1-222, Transcript of catenin delta 1, human

TSL 5 BASIC

Gene CTNND1, Length 4,780 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTNND1-222	ENST00000529919	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919		A0A0B4J203	849 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	NXPH2	O95156	264 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	F10	P00742	488 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	OR10J4	P0C629	311 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	NID1	P14543	1247 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	PTAFR	P25105	342 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	CHRNB4	P30926	498 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	OR10A3	P58181	314 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	MZT1	Q08AG7	82 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	PLPP6	Q8IY26	295 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	PFN4	Q8NHR9	129 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	CMBL	Q96DG6	245 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	SRR	Q9GZT4	340 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	SLC2A10	O95528	541 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	CD3D	P04234	171 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	KIR2DL3	P43628	341 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	MLF1	P58340	268 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	DUSP5	Q16690	384 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	PATE1	Q8WXA2	126 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	OPALIN	Q96PE5	141 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	CRLF2	Q9HC73	371 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	CMC2	Q9NRP2	79 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919		A0A1W2PPQ1	181 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	BTBD17	A6NE02	478 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	IFITM5	A6NNB3	132 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	GPR171	O14626	319 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	UTS2	O95399	124 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	CT45A6	P0DMU7	189 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	CT45A5	P0DMU8	189 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	CT45A7	P0DMV0	189 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	CT45A8	P0DMV1	189 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	CT45A9	P0DMV2	189 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	CD1E	P15812	388 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	DCTD	P32321	178 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	AKR1C3	P42330	323 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	CSNK1G2	P78368	415 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	AANAT	Q16613	207 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	TMEM18	Q96B42	140 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	LRFN5	Q96NI6	719 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	SPACA5	Q96QH8	159 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	IER2	Q9BTL4	223 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	ASIC5	Q9NY37	505 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	COL4A5	P29400	1685 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CTNND1-222	ENST00000529919	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		7.26	□□□□□ -1.25

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