RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 COPS3Q9UNS2 423 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 POLR1DQ9Y2S0 133 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 TPRKBQ9Y3C4 175 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 PHYHO14832 338 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 APOL3O95236 402 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 WNT11O96014 354 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 IGKV3-15P01624 115 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 IGLV1-44P01699 117 aa14.61□□□□□ -0.07
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PACS1-208ENST00000529677 DCKP27707 260 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 RPS27P42677 84 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
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PACS1-208ENST00000529677 GSG1Q2KHT4 349 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 RNLSQ5VYX0 342 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 TMEM53Q6P2H8 277 aa14.61□□□□□ -0.07
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PACS1-208ENST00000529677 LINC00346Q8IVM7 164 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 OR10S1Q8NGN2 331 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 RNF133Q8WVZ7 376 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 ASB17Q8WXJ9 295 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 ZNF649Q9BS31 505 aa14.61□□□□□ -0.07
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PACS1-208ENST00000529677 C1orf198Q9H425 327 aa14.61□□□□□ -0.07
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PACS1-208ENST00000529677 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 BLOC1S6Q9UL45 172 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 MYRFQ9Y2G1 1151 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 OR6C6A6NF89 314 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 RER1O15258 196 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 RAB36O95755 333 aa14.6□□□□□ -0.07
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PACS1-208ENST00000529677 ADRA2AP08913 450 aa14.6□□□□□ -0.07
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PACS1-208ENST00000529677 COX5BP10606 129 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 ATP6V1E1P36543 226 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 RAB1AP62820 205 aa14.6□□□□□ -0.07
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PACS1-208ENST00000529677 TUBA4AP68366 448 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 ROM1Q03395 351 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 ZNF85Q03923 595 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 ST3GAL4Q11206 333 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 PPA1Q15181 289 aa14.6□□□□□ -0.07
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PACS1-208ENST00000529677 EGFL6Q8IUX8 553 aa14.6□□□□□ -0.07
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PACS1-208ENST00000529677 ZNF540Q8NDQ6 660 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 OR52N5Q8NH56 324 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
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PACS1-208ENST00000529677 AMELYQ99218 206 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 COPS4Q9BT78 406 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 HDHD2Q9H0R4 259 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 LAMP5Q9UJQ1 280 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 PRR32B1ATL7 298 aa14.59□□□□□ -0.07
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PACS1-208ENST00000529677 CDK1P06493 297 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 CD79AP11912 226 aa14.59□□□□□ -0.07
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PACS1-208ENST00000529677 CHN2P52757 468 aa14.59□□□□□ -0.07
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PACS1-208ENST00000529677 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 ELFN2Q5R3F8 820 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 SHEQ5VZ18 495 aa14.59□□□□□ -0.07
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PACS1-208ENST00000529677 AHSA2Q719I0 299 aa14.59□□□□□ -0.07
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PACS1-208ENST00000529677 COQ7Q99807 217 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PACS1-208ENST00000529677 A0A1W2PR80 420 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 RNF212BA8MTL3 300 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 SERPINA5P05154 406 aa14.58□□□□□ -0.08
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