RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515479.5

RUFY3-215, Transcript of RUN and FYVE domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RUFY3, Length 893 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3-215ENST00000515479 IFNA14P01570 189 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 IFNW1P05000 195 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 BCHEP06276 602 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 TFPTP0C1Z6 253 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 GIMD1P0DJR0 217 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 PRKAR1AP10644 381 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 VPREB1P12018 145 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 CTSEP14091 401 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 PSMB9P28065 219 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 CD40LGP29965 261 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 RCVRNP35243 200 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 UGT2B10P36537 528 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 TSFMP43897 325 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 OR1E2P47887 323 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 KHKP50053 298 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 RAB28P51157 221 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 KIAA1024LP59773 190 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 NCS1P62166 190 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 C2orf80Q0P641 193 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 DEFB133Q30KQ1 61 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 MOGAT2Q3SYC2 334 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 C14orf28Q4W4Y0 310 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 PHLDA2Q53GA4 152 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 DCAF12Q5T6F0 453 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 Q6ZR54 194 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 Q6ZSR6 202 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 FAM92BQ6ZTR7 304 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 PAGE2Q7Z2X7 111 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 AKAP14Q86UN6 197 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 GKN2Q86XP6 184 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 ELMOD2Q8IZ81 293 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 SLC38A6Q8IZM9 456 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 AQP11Q8NBQ7 271 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF540Q8NDQ6 660 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 TTLQ8NG68 377 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 OR4D11Q8NGI4 311 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 OR2A1Q8NGT9 310 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 RHOXF1Q8NHV9 184 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 SPPL2AQ8TCT8 520 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 PROX1Q92786 737 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 SLC38A4Q969I6 547 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 SLC35G5Q96KT7 338 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 LURAP1Q96LR2 239 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 PRRC1Q96M27 445 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 AMDHD1Q96NU7 426 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 COL21A1Q96P44 957 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 COPS4Q9BT78 406 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 DDA1Q9BW61 102 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 TAPBPLQ9BX59 468 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 CDCA4Q9BXL8 241 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 NLNQ9BYT8 704 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 LRRN3Q9H3W5 708 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 SLC25A19Q9HC21 320 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 BCL2L10Q9HD36 194 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 AHSPQ9NZD4 102 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 C5AR2Q9P296 337 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 P2RX2Q9UBL9 471 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 NUP50Q9UKX7 468 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 SNX7Q9UNH6 387 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 U3KQA8 63 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 CCDC168Q8NDH2 2452 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 SEC16AO15027 2179 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 CSMD1Q96PZ7 3565 aa3.56□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 FREM3P0C091 2139 aa3.55□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 FEZF1A0PJY2 475 aa3.55□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 A6NCN8 305 aa3.55□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 LRIT2A6NDA9 550 aa3.55□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 EFCAB10A6NFE3 127 aa3.55□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 ANKDD1BA6NHY2 528 aa3.55□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa3.55□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 MPTX1A8MV57 137 aa3.55□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 PTGES3LE9PB15 166 aa3.55□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 CASC3O15234 703 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 SLC31A1O15431 190 aa3.55□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 MPZL2O60487 215 aa3.55□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 RAD1O60671 282 aa3.55□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 B3GALNT1O75752 331 aa3.55□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 AIFM1O95831 613 aa3.55□□□□□ -1.84
RUFY3-215ENST00000515479 SCGB1D1O95968 90 aa3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms