RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 FADS2O95864 444 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 TSPAN19P0C672 248 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 FCGR1AP12314 374 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ACP5P13686 325 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SAT1P21673 171 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CSF2RBP32927 897 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SSTR5P35346 364 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 DPTQ07507 201 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 TGIF1Q15583 401 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 TNXAQ16473 311 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PLPPR5Q32ZL2 321 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 EIPR1Q53HC9 387 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 COX20Q5RI15 118 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR4F3Q6IEY1 312 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ZDHHC24Q6UX98 284 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC35E3Q7Z769 313 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 COMMD2Q86X83 199 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PDZD9Q8IXQ8 264 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 GPR135Q8IZ08 494 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CMTM1Q8IZ96 169 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 RAB42Q8N4Z0 105 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR4D5Q8NGN0 318 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 RDH11Q8TC12 318 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 LCN9Q8WX39 176 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 MOAP1Q96BY2 351 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SCRN2Q96FV2 425 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 H2AFJQ9BTM1 129 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 RSG1Q9BU20 258 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 TEX101Q9BY14 249 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 MEGF9Q9H1U4 602 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ALG9Q9H6U8 611 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 MEAF6Q9HAF1 191 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 G6PC2Q9NQR9 355 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 B3GAT1Q9P2W7 334 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ATG4BQ9Y4P1 393 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 NUMA1Q14980 2115 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A1W2PQM1 296 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A1W2PRX2 142 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CTSVO60911 334 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 RDH16O75452 317 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SIX6O95475 246 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 GPR75O95800 540 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 TGFB1P01137 390 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 FTLP02792 175 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ITGA5P08648 1049 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 LIFP15018 202 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 NCK1P16333 377 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 DUSP1P28562 367 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CHRNB4P30926 498 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 GABRA4P48169 554 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PRSS12P56730 875 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ERVFC1-1P60608 527 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 EGR4Q05215 589 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 GCSAMLQ5JQS6 135 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 C9orf135Q5VTT2 229 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CST9LP1Q5W188 147 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 STEAP1BQ6NZ63 245 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 DEFB107AQ8IZN7 70 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR56A1Q8NGH5 318 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 TAAR8Q969N4 342 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ADGRG7Q96K78 797 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM43Q9BTV4 400 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ADI1Q9BV57 179 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PRR14Q9BWN1 585 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SIX2Q9NPC8 291 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ERVK13-1Q9NX77 482 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 STEAP1Q9UHE8 339 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SERTAD3Q9UJW9 196 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ARL5AQ9Y689 179 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM202A6NGA9 273 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 J3KR12 359 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CEACAM4O75871 244 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR2F2O95006 317 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR6A2O95222 327 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 UTS2O95399 124 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 IL18BPO95998 194 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 MIPP30301 263 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ZP4Q12836 540 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 TCTN3Q6NUS6 607 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 Q6ZVL8 140 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF130Q86XS8 419 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 BCORP1Q8N888 145 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR14K1Q8NGZ2 314 aa4.1□□□□□ -1.75
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