RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 NPBWR1P48145 328 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 HCCSP53701 268 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MLF1P58340 268 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ST3GAL4Q11206 333 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 IL10RAQ13651 578 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM69BQ5VUD6 431 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF730Q6ZMV8 503 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SSX6Q7RTT6 188 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC5A8Q8N695 610 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 C10orf53Q8N6V4 93 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 Q8NFD4 153 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5R1Q8NH85 324 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RASL10BQ96S79 203 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM138Q9NPI0 162 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NDUFB11Q9NX14 153 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 FLRT3Q9NZU0 649 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MOKQ9UQ07 419 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 DMDP11532 3685 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A0B4J2E0 115 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1B0GX12 115 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TP53I11O14683 189 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SURF4O15260 269 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2T1O43869 369 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TOXO94900 526 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RPP14O95059 124 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NXPH2O95156 264 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 LYPD3O95274 346 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST1H2ABP04908 130 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GKN3PP0CG01 181 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 DAOP14920 347 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CD46P15529 392 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ADCYAP1P18509 176 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 BTCP35070 178 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SERPINF1P36955 418 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RAD52P43351 418 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SELENOPP49908 381 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 LSM6P62312 80 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RSU1Q15404 277 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 DCAF10Q5QP82 559 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PODNL1Q6PEZ8 512 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2G2Q8NGZ5 317 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR52J3Q8NH60 311 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC7A13Q8TCU3 470 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ACOT12Q8WYK0 555 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST1H2ACQ93077 130 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ARSGQ96EG1 525 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 FEVQ99581 238 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PIGQQ9BRB3 760 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ALG8Q9BVK2 526 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TMED9Q9BVK6 235 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ABCG5Q9H222 651 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ISYNA1Q9NPH2 558 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GPR83Q9NYM4 423 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RHCGQ9UBD6 479 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 HEATR5AQ86XA9 2040 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ITGA10O75578 1167 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2J2O76002 312 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 IGF2P01344 180 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 IFNA17P01571 189 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GSTM3P21266 225 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SSR4P51571 173 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CCR4P51679 360 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CD226Q15762 336 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 WBP2NLQ6ICG8 309 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR52W1Q6IF63 320 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 C1orf94Q6P1W5 598 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ULK3Q6PHR2 472 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 APOOLQ6UXV4 268 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
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