RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 BCL7BQ9BQE9 202 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 HSBP1O75506 76 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 BCHEP06276 602 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 KRT16P08779 473 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 CD3GP09693 182 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 RAB4AP20338 218 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 GPR1P46091 355 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 HCAR3P49019 387 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF33AQ06730 810 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 IRF4Q15306 451 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 H3F3CQ6NXT2 135 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJC24Q6P3W2 148 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 PLET1Q6UQ28 207 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 C12orf54Q6X4T0 127 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 VTCN1Q7Z7D3 282 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 CBLN2Q8IUK8 224 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 ENTHD1Q8IYW4 607 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 CMTM8Q8IZV2 173 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 SLC34A3Q8N130 599 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 METTL13Q8N6R0 699 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF321PQ8N8H1 164 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 SNX31Q8N9S9 440 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC75AQ8NAA5 344 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 PROKR2Q8NFJ6 384 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC29Q8WV35 223 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 COL21A1Q96P44 957 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 TBX21Q9UL17 535 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 GAKO14976 1311 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 IL32P24001 234 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 NBL1P41271 181 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 RAP1AP62834 184 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 ORMDL2Q53FV1 153 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 HORMAD1Q86X24 394 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 NRBF2Q96F24 287 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 CERS2Q96G23 380 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 CYP3A43Q9HB55 503 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 SLC39A1Q9NY26 324 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 RAB26Q9ULW5 256 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 LRP4O75096 1905 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINE3A8MV23 424 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 CHMP2AO43633 222 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 FARS2O95363 451 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 OR1G1P47890 313 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 BCAP31P51572 246 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 MADCAM1Q13477 382 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 KIR2DS1Q14954 304 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 ADNP2Q6IQ32 1131 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 FAM122BQ7Z309 247 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00523Q86TU6 105 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF547Q8IVP9 402 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 FAM86B1Q8N7N1 296 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 OR52K1Q8NGK4 314 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 ITFG1Q8TB96 612 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 NAT6Q93015 286 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 GPR21Q99679 349 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 DEFB129Q9H1M3 183 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 MYOZ2Q9NPC6 264 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 DYRK4Q9NR20 520 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 MCUBQ9NWR8 336 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 DDX19BQ9UMR2 479 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 NISCHQ9Y2I1 1504 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 SYCE1LA8MT33 242 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 PLPP1O14494 284 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 RP2O75695 350 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 TCN2P20062 427 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 RPEL1Q2QD12 228 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 CAVIN4Q5BKX8 364 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 SAXO1Q8IYX7 474 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 OR10AD1Q8NGE0 317 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 OR5T3Q8NGG3 340 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 RPEQ96AT9 228 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 APH1AQ96BI3 265 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 SPNS1Q9H2V7 528 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 CD209Q9NNX6 404 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 HMG20AQ9NP66 347 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 FHOD3Q2V2M9 1422 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PP18 115 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-212ENST00000491302 H7C417 338 aa4.9□□□□□ -1.63
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