RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490540.1

ASIC3-208, Transcript of acid sensing ion channel subunit 3, human

TSL 2

Gene ASIC3, Length 520 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ASIC3-208	ENST00000490540	PNP	P00491	289 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	CD55	P08174	381 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	EGR1	P18146	543 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	KITLG	P21583	273 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	MNAT1	P51948	309 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	SMIM11A	P58511	58 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	CDK5R2	Q13319	367 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	KCNMB1	Q16558	191 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	OR6V1	Q8N148	313 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	C3orf56	Q8N813	242 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	RAB39B	Q96DA2	213 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	NSL1	Q96IY1	281 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	WDR76	Q9H967	626 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	B9D1	Q9UPM9	204 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	OR6C68	A6NDL8	312 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540		B2RBV5	119 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	REN	P00797	406 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	ADRA2C	P18825	462 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	CALB2	P22676	271 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	CRABP1	P29762	137 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	LIPA	P38571	399 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	GSS	P48637	474 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	HIST1H3A	P68431	136 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	LCN2	P80188	198 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	OR2T2	Q6IF00	324 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	HAVCR1	Q96D42	359 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	DIRC2	Q96SL1	478 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540		H0YL77	283 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	ARPC3	O15145	178 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	IGHV2-70	P01814	119 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	SBK2	P0C263	348 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	ANPEP	P15144	967 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	TNFSF4	P23510	183 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	NOS3	P29474	1203 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	PYCR1	P32322	319 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	SLC3A1	Q07837	685 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	COX10	Q12887	443 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	TSPAN31	Q12999	210 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	GJC3	Q8NFK1	279 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	OR2V2	Q96R30	315 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	COQ7	Q99807	217 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	VNN3	Q9NY84	501 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	NPTN	Q9Y639	398 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540		A0A0G2JMP0	313 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540		A0A0X1KG70	313 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	TNFRSF11B	O00300	401 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	ZNF205	O95201	554 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	HLA-DQA2	P01906	255 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	PSKH1	P11801	424 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	RAC2	P15153	192 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	IFNGR2	P38484	337 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ASIC3-208	ENST00000490540	RGS6	P49758	472 aa		10.1	□□□□□ -0.79

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