RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487476.5

NF1-211, Transcript of neurofibromin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NF1, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1-211ENST00000487476 CD79BP40259 229 aa14.76□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 P2RY6Q15077 328 aa14.76□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 MED22Q15528 200 aa14.76□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 STK11Q15831 433 aa14.76□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 TSTQ16762 297 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 PCK2Q16822 640 aa14.76□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 ANKRD16Q6P6B7 361 aa14.76□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 OTOSQ8NHW6 89 aa14.76□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 THEM6Q8WUY1 208 aa14.76□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 CDCA4Q9BXL8 241 aa14.76□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 RAB36O95755 333 aa14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 IGHA1P01876 353 aa14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 LSM6P62312 80 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 ZNF85Q03923 595 aa14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 SLC18B1Q6NT16 456 aa14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 CFAP77Q6ZQR2 320 aa14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 SPATC1Q76KD6 591 aa14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 DCXRQ7Z4W1 244 aa14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 LILRB4Q8NHJ6 448 aa14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 MAP6Q96JE9 813 aa14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 MYO18BQ8IUG5 2567 aa14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 ALOX5APP20292 161 aa14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 SOX6P35712 828 aa14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 ETV6P41212 452 aa14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 CAPZA2P47755 286 aa14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 TGFBR3Q03167 851 aa14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 TBRG1Q3YBR2 411 aa14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 TEX30Q5JUR7 227 aa14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 SLC16A14Q7RTX9 510 aa14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 ACBD7Q8N6N7 88 aa14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 MGLLQ99685 303 aa14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 ABHD6Q9BV23 337 aa14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 NOX3Q9HBY0 568 aa14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 LAMP5Q9UJQ1 280 aa14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.75□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 DAPL1A0PJW8 107 aa14.74□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 CST2P09228 141 aa14.74□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 OR2T7P0C7T2 308 aa14.74□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 LIMS3P0CW19 117 aa14.74□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 LIMS4P0CW20 117 aa14.74□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 C22orf34Q6ZV56 151 aa14.74□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 CCDC190Q86UF4 302 aa14.74□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 OR10S1Q8NGN2 331 aa14.74□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 OR2T27Q8NH04 317 aa14.74□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 ST7LQ8TDW4 575 aa14.74□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa14.74□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 ERVK13-1Q9NX77 482 aa14.74□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 CCRL2O00421 344 aa14.73□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 FARS2O95363 451 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 CD79AP11912 226 aa14.73□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 ZNF32P17041 273 aa14.73□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 GRNP28799 593 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 CCKARP32238 428 aa14.73□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 SSX1Q16384 188 aa14.73□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.73□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 GDPD3Q7L5L3 318 aa14.73□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 CACNA1CQ13936 2221 aa14.73□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 SSX4O60224 188 aa14.73□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa14.73□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 NRN1LQ496H8 165 aa14.73□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa14.73□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 WDR31Q8NA23 367 aa14.73□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 OR52N5Q8NH56 324 aa14.73□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 ASB5Q8WWX0 329 aa14.73□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 S100PBPQ96BU1 408 aa14.73□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 KCNS3Q9BQ31 491 aa14.73□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa14.72□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 RCVRNP35243 200 aa14.72□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 DEFA1P59665 94 aa14.72□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 DEFA3P59666 94 aa14.72□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 PSG4Q00888 419 aa14.72□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa14.72□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 OR2G6Q5TZ20 316 aa14.72□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 MTFR2Q6P444 385 aa14.72□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa14.72□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 AKR7LQ8NHP1 331 aa14.72□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa14.72□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa14.72□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 IRGMA1A4Y4 181 aa14.72□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa14.72□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 TMCC2O75069 709 aa14.72□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 GPX5O75715 221 aa14.72□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 AGFG2O95081 481 aa14.72□□□□□ -0.05
NF1-211ENST00000487476 IL32P24001 234 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms