RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484893.1

GINS1-204, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene GINS1, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-204ENST00000484893 LCN1P1Q5VSP4 162 aa11.2□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 MEDAGQ5VYS4 303 aa11.2□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 C11orf71Q6IPW1 123 aa11.2□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 KRT80Q6KB66 452 aa11.2□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa11.2□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 SHFQ7M4L6 423 aa11.2□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 SSX6Q7RTT6 188 aa11.2□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 PRSS45Q7RTY3 260 aa11.2□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa11.2□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ZNF454Q8N9F8 522 aa11.2□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 OR1J2Q8NGS2 313 aa11.2□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa11.2□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 CNIH3Q8TBE1 160 aa11.2□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 SLAMF6Q96DU3 332 aa11.2□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ATF6BQ99941 703 aa11.2□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 DHRS9Q9BPW9 319 aa11.2□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 CDADC1Q9BWV3 514 aa11.2□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 CA10Q9NS85 328 aa11.2□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 MPZL2O60487 215 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 FAM157BP0CG42 384 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 CD53P19397 219 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 GLRXP35754 106 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 NUDT6P53370 316 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ROM1Q03395 351 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ZNF91Q05481 1191 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ECH1Q13011 328 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 CDK5R2Q13319 367 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 SWI5Q1ZZU3 235 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 IZUMO2Q6UXV1 221 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 RHOUQ7L0Q8 258 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 DTX2Q86UW9 622 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 SLC35F2Q8IXU6 374 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 OR51G2Q8NGK0 314 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 LGALS12Q96DT0 336 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 C4orf45Q96LM5 186 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 APOL4Q9BPW4 351 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 RHNO1Q9BSD3 238 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ZNF442Q9H7R0 627 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 UBTD1Q9HAC8 227 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 CDH20Q9HBT6 801 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 AMBNQ9NP70 447 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 CLN6Q9NWW5 311 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 STARD10Q9Y365 291 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ATP23Q9Y6H3 246 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 USF3Q68DE3 2245 aa11.19□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 OVOL3O00110 214 aa11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 TMCC2O75069 709 aa11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ATE1O95260 518 aa11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ABHD16AO95870 558 aa11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 LYNP07948 512 aa11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 DBTP11182 482 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ZNF250P15622 560 aa11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 TTKP33981 857 aa11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 VHLP40337 213 aa11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 MTNR1AP48039 350 aa11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ZNF85Q03923 595 aa11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ZNF544Q6NX49 715 aa11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 PAMR1Q6UXH9 720 aa11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 SPATC1Q76KD6 591 aa11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 LRP11Q86VZ4 500 aa11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 RFKQ969G6 155 aa11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 FBXW5Q969U6 566 aa11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 RNFT2Q96EX2 444 aa11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 VCXQ9H320 206 aa11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 TBCCD1Q9NVR7 557 aa11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ZNF319Q9P2F9 582 aa11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 MYRFQ9Y2G1 1151 aa11.18□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ZNF878C9JN71 531 aa11.17□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 CLPTM1O96005 669 aa11.17□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 OR4A8P0C604 315 aa11.17□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 CCNOP22674 350 aa11.17□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 MYF6P23409 242 aa11.17□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 IL5RAQ01344 420 aa11.17□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 POU4F2Q12837 409 aa11.17□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 EFNB3Q15768 340 aa11.17□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 THAP5Q7Z6K1 395 aa11.17□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 THEM6Q8WUY1 208 aa11.17□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 OR8B4Q96RC9 309 aa11.17□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 DOK1Q99704 481 aa11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms