RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 OXA1LQ15070 435 aa5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 OR8B8Q15620 311 aa5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 LINC00303Q3SY05 128 aa5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 HSD17B12Q53GQ0 312 aa5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 ANKRD16Q6P6B7 361 aa5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 RPTNQ6XPR3 784 aa5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 AAED1Q7RTV5 226 aa5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 SLC22A24Q8N4F4 322 aa5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 OR14K1Q8NGZ2 314 aa5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 PIGTQ969N2 578 aa5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 HDHD5Q9BXW7 423 aa5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 OR2H1Q9GZK4 316 aa5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 PBOV1Q9GZY1 135 aa5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 WNT5BQ9H1J7 359 aa5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 PRORYQ9H606 182 aa5.65□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 IFITM5A6NNB3 132 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 G3V3Y1 287 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 GPANK1O95872 356 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 PDGFAP04085 211 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF24P17028 368 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 ADRA2CP18825 462 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 TNFSF8P32971 234 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 THBS4P35443 961 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 DEFB109BQ30KR1 87 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 UBE2NLQ5JXB2 153 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF813Q6ZN06 617 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 PGAP1Q75T13 922 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 DOK3Q7L591 496 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 CEACAM19Q7Z692 300 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 KRT77Q7Z794 578 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 KDM8Q8N371 416 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 Q8NA96 180 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 OR51L1Q8NGJ5 315 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 OR1K1Q8NGR3 316 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 HSD17B8Q92506 261 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 FOXB1Q99853 325 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 SLC30A2Q9BRI3 323 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 TMED9Q9BVK6 235 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 SCNM1Q9BWG6 230 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 HHLA2Q9UM44 414 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 NCOR1O75376 2440 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 GMFGO60234 142 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 UBL3O95164 117 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 FAM157BP0CG42 384 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 MPGP29372 298 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 ARR3P36575 388 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 PLGLB1Q02325 96 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC157Q569K6 752 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 DDI2Q5TDH0 399 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 ARL9Q6T311 187 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 SLC16A14Q7RTX9 510 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 OR2W3Q7Z3T1 314 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 OR52H1Q8NGJ2 320 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 C15orf40Q8WUR7 153 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 EMC6Q9BV81 110 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 ULBP2Q9BZM5 246 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 CSAG2Q9Y5P2 127 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 GON4LQ3T8J9 2241 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 H0YC42 278 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 SLC17A2O00624 439 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 DVL2O14641 736 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 IGLV1-44P01699 117 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 CLEC2LP0C7M8 214 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 ASAH1Q13510 395 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 FBXW9Q5XUX1 488 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 RTL6Q6ICC9 239 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 SEM1Q6ZVN7 128 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 CDH24Q86UP0 819 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 LYSMD2Q8IV50 215 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 OR10H5Q8NGA6 315 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 RAB40AQ8WXH6 277 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 PPP1R14BQ96C90 147 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 LYZL4Q96KX0 146 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 TBX5Q99593 518 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 KCNS3Q9BQ31 491 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM185BQ9H7F4 350 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 RHOFQ9HBH0 211 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 NOX4Q9NPH5 578 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 IL36GQ9NZH8 169 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 CACNA1GO43497 2377 aa5.64□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa5.63□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 PEX14O75381 377 aa5.63□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 CA11O75493 328 aa5.63□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 TNFSF13O75888 250 aa5.63□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 PTTG1O95997 202 aa5.63□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 ITGA5P08648 1049 aa5.63□□□□□ -1.51
PRKCI-202ENST00000476635 NAT2P11245 290 aa5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 128.6 ms