RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	STARD10	Q9Y365	291 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	GSC2	O15499	205 aa		12.63	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	FKBP6	O75344	327 aa		12.63	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	TGFA	P01135	160 aa		12.63	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	SPARC	P09486	303 aa		12.63	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF3	P17036	446 aa		12.63	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	GIF	P27352	417 aa		12.63	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	MVK	Q03426	396 aa		12.63	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	CRMP1	Q14194	572 aa		12.63	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		12.63	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	AVPI1	Q5T686	147 aa		12.63	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	FAM166A	Q6J272	317 aa		12.63	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		12.63	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		12.63	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	OR5AS1	Q8N127	324 aa		12.63	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		12.63	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		12.63	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	CMBL	Q96DG6	245 aa		12.63	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		12.63	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		12.63	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	WDR76	Q9H967	626 aa		12.63	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		12.63	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		12.63	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		12.63	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	LMX1B	O60663	402 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	CRLF1	O75462	422 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV1-46	P01743	117 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	PRKACG	P22612	351 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	SLC6A9	P48067	706 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	BNIP1	Q12981	228 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	PSG7	Q13046	419 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	RIN1	Q13671	783 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	TAF13	Q15543	124 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	HFE	Q30201	348 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	LNX2	Q8N448	690 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	CCL17	Q92583	94 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	COG8	Q96MW5	612 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	COQ7	Q99807	217 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	ATF6B	Q99941	703 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	BEX2	Q9BXY8	128 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	MED20	Q9H944	212 aa		12.62	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	ISPD	A4D126	451 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	FAM183A	A6NL82	134 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	CLDN25	C9JDP6	229 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880		H3BSA7	217 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	LILRA1	O75019	489 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	TIPRL	O75663	272 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	ATP5H	O75947	161 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	LCAT	P04180	440 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	CLU	P10909	449 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	TNFSF4	P23510	183 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	FMO3	P31513	532 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	IL2RG	P31785	369 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	LIPA	P38571	399 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	RGS6	P49758	472 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	COX10	Q12887	443 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	GK3P	Q14409	553 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	SPATC1	Q76KD6	591 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	TIMD4	Q96H15	378 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	CENPM	Q9NSP4	180 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	CACNG2	Q9Y698	323 aa		12.61	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	CIB2	O75838	187 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	SPI1	P17947	270 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	MMP15	P51511	669 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	TPTE	P56180	551 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	PRSS12	P56730	875 aa		12.6	□□□□□ -0.39

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