RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 SUCNR1Q9BXA5 334 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 EGLN1Q9GZT9 426 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYLK2Q9H1R3 596 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 GCM1Q9NP62 436 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLEK2Q9NYT0 353 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 GRHPRQ9UBQ7 328 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 IL19Q9UHD0 177 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATPIF1Q9UII2 106 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPIAL4AQ9Y536 164 aa7.09□□□□□ -1.27
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLXNB1O43157 2135 aa7.09□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 TGP01266 2768 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1W2PRQ8 180 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 IQCF6A8MYZ5 107 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC16A7O60669 478 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPP1R3DO95685 299 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 H1F0P07305 194 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 WNT2P09544 360 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 HKR1P10072 659 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 PSKH1P11801 424 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAC2P15153 192 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 GSTM3P21266 225 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 TUBG1P23258 451 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 IFNA8P32881 189 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD80P33681 288 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARHGDIAP52565 204 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 PAX8Q06710 450 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 COX10Q12887 443 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 SCGB2A2Q13296 93 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 DGCR6Q14129 220 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZMAT1Q5H9K5 638 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM201AQ5SY85 155 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR139Q6DWJ6 353 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR2T2Q6IF00 324 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 C1orf94Q6P1W5 598 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 DOK3Q7L591 496 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZER1Q7Z7L7 766 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 BPIFB2Q8N4F0 458 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 TEX29Q8N6K0 151 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC26A10Q8NG04 563 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR10AD1Q8NGE0 317 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR1F12Q8NHA8 337 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 ST7LQ8TDW4 575 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTP4A1Q93096 173 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 MEGF10Q96KG7 1140 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC30A2Q9BRI3 323 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM165Q9HC07 324 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 TUBG2Q9NRH3 451 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTTG3PQ9NZH4 202 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM5Q9Y2B1 443 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 AP3M1Q9Y2T2 418 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa7.08□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 NOTCH1P46531 2555 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 C5orf63A6NC05 138 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 J3QW42 95 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 XKRYO14609 159 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 FCN3O75636 299 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF205O95201 554 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLATP00750 562 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 RHCEP18577 417 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 TNFRSF1AP19438 455 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 MDH2P40926 338 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 NUDT2P50583 147 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAD23AP54725 363 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 PSME3P61289 254 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAB21L1Q13394 359 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 FGD3Q5JSP0 725 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 GLYATQ6IB77 296 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC18B1Q6NT16 456 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 CORO6Q6QEF8 472 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 CFAP77Q6ZQR2 320 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 FKBP9P1Q75LS8 142 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADCK1Q86TW2 530 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 NAA40Q86UY6 237 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 GLB1L2Q8IW92 636 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR6V1Q8N148 313 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPICQ8N5J4 248 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR8G5Q8NG78 346 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR10S1Q8NGN2 331 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNRF4Q8WWF5 429 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM162AQ96A26 154 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 DUX5Q96PT3 197 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 JMJD8Q96S16 334 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 DDOQ99489 341 aa7.07□□□□□ -1.28
GAPDHP28-201ENST00000455134 COQ7Q99807 217 aa7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms