RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448372.5

SENP1-201, Transcript of SUMO specific peptidase 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP1, Length 4,679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1-201ENST00000448372 TPOP07202 933 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 CD63P08962 238 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 ATF1P18846 271 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 KITLGP21583 273 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.355e-10■■■□□ 18.3
SENP1-201ENST00000448372 LAP3P28838 519 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 GRB2P62993 217 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 DOC2BQ14184 412 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 ZNF74Q16587 644 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 C12orf73Q69YU5 71 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 DOK3Q7L591 496 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 OR51F2Q8NH61 342 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 ZNF799Q96GE5 643 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 JAM3Q9BX67 310 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 DEFB127Q9H1M4 99 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 ATPIF1Q9UII2 106 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 OR5H14A6NHG9 310 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 LGALS8O00214 317 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 OIP5O43482 229 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 TNFSF4P23510 183 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 HRH1P35367 487 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 CLDN20P56880 219 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 TAS2R30P59541 319 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 BDH1Q02338 343 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 CATR1Q13166 79 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 ZFP82Q8N141 532 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 POC1BQ8TC44 478 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 MARC2Q969Z3 335 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 APH1AQ96BI3 265 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 LRRC46Q96FV0 321 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 AP1S3Q96PC3 154 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 OR2A14Q96R47 310 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 NUDT9Q9BW91 350 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 TWSG1Q9GZX9 223 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 CRLF2Q9HC73 371 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 KCND3Q9UK17 655 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 B9D1Q9UPM9 204 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 SIGLEC7Q9Y286 467 aa6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 ZFP92A6NM28 416 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 PRSS23O95084 383 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 OLFM2O95897 454 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 GIPP09681 153 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 TBXA2RP21731 343 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 RBP2P50120 134 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 CDC20Q12834 499 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 FOXF1Q12946 379 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 GPNMBQ14956 572 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 LINC00303Q3SY05 128 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 LANCL3Q6ZV70 420 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 TMEM200AQ86VY9 491 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 LGI3Q8N145 548 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 OR52N5Q8NH56 324 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 ISYNA1Q9NPH2 558 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 POMT2Q9UKY4 750 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 CKAP5Q14008 2032 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 C2CD4DB7Z1M9 353 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 NME2P1O60361 137 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 WDR1O75083 606 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 C1QCP02747 245 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 CISD3P0C7P0 127 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 NFYBP25208 207 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 CD80P33681 288 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 FMODQ06828 376 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 BAXQ07812 192 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 FAM53BQ14153 422 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 IFI44Q8TCB0 444 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 SEH1LQ96EE3 360 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 LRRC61Q9BV99 259 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 BCO1Q9HAY6 547 aa6.59□□□□□ -1.35
SENP1-201ENST00000448372 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms