RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447046.1

AC004980.3-201, humanhuman

BASIC

Gene AC004980.3, Length 365 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004980.3-201ENST00000447046 CCR9P51686 369 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 CAPZA1P52907 286 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 B3GALT5-AS1P59052 145 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 GRB2P62993 217 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 SRYQ05066 204 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 RBPJQ06330 500 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 CAMK2DQ13557 499 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 SGCAQ16586 387 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 CDONQ4KMG0 1287 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 YIF1BQ5BJH7 314 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 MESTQ5EB52 335 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 LIPKQ5VXJ0 399 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 ARL9Q6T311 187 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 CDC20BQ86Y33 519 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 KLBQ86Z14 1044 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 ZNF100Q8IYN0 542 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 KDM8Q8N371 416 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 ZNF676Q8N7Q3 588 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 SYT14Q8NB59 555 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 BBS1Q8NFJ9 593 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 OR5M1Q8NGP8 315 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 OR6N2Q8NGY6 317 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 OR5AK2Q8NH90 309 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 OTOSQ8NHW6 89 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 CPT1CQ8TCG5 803 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 ACOT12Q8WYK0 555 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 SPTSSAQ969W0 71 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 TMEM45BQ96B21 275 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 FAM122AQ96E09 287 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 LRRC46Q96FV0 321 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 C4orf36Q96KX1 117 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 SNX22Q96L94 193 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 CEP19Q96LK0 163 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 C8orf49Q96NF6 230 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 OR5M11Q96RB7 305 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 TRIB1Q96RU8 372 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 TBX5Q99593 518 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 MED18Q9BUE0 208 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 ULBP2Q9BZM5 246 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 CXorf56Q9H5V9 222 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 HMG20AQ9NP66 347 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 RABL2BQ9UNT1 228 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 PEX16Q9Y5Y5 336 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 CCDC88CQ9P219 2028 aa4.53□□□□□ -1.68
AC004980.3-201ENST00000447046 SPTBP11277 2137 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 SCN2AQ99250 2005 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 A0A1B0GVC2 190 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 TMEM8BA6NDV4 472 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 CCDC182A6NF36 153 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 LRRC3CA6NJW4 275 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 SLC22A20A6NK97 555 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 K7ENP7 123 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 TAF4O00268 1085 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 ADAM10O14672 748 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 CASKO14936 926 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 DHHO43323 396 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 CLPXO76031 633 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 NCR1O76036 304 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 F10P00742 488 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 IGHG3P01860 377 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 CRHP06850 196 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 SPARCP09486 303 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 RFPL3SP0C7P2 107 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 PGA4P0DJD7 388 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 PGA3P0DJD8 388 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 OR8G3PP0DMU2 310 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 CLUP10909 449 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 ZNF708P17019 499 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 ALOX5APP20292 161 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 MSR1P21757 451 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 GADD45AP24522 165 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 ARR3P36575 388 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 LIPAP38571 399 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 CASP6P55212 293 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 CLDN20P56880 219 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 PLP2Q04941 152 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 AQP6Q13520 282 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 RAB32Q13637 225 aa4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
AC004980.3-201ENST00000447046 FAM189A2Q15884 450 aa4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.7 ms