RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	MSMP	Q1L6U9	139 aa		12.56	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		12.56	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		12.56	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	CORO6	Q6QEF8	472 aa		12.56	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		12.56	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		12.56	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		12.56	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		12.56	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	TIGD4	Q8IY51	512 aa		12.56	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		12.56	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF511	Q8NB15	262 aa		12.56	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		12.56	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	ABHD4	Q8TB40	342 aa		12.56	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM163	Q8TC26	289 aa		12.56	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	SPTSSA	Q969W0	71 aa		12.56	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	WDR76	Q9H967	626 aa		12.56	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		12.56	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	TVP23A	A6NH52	213 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF878	C9JN71	531 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	SLC15A1	P46059	708 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	TPTE	P56180	551 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	CDC42	P60953	191 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	FAM209A	Q5JX71	171 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	GID4	Q8IVV7	300 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	CBR4	Q8N4T8	237 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	ST7L	Q8TDW4	575 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	SNX33	Q8WV41	574 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	OTULIN	Q96BN8	352 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	MAP6	Q96JE9	813 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	RDH12	Q96NR8	316 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	TOR3A	Q9H497	397 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	MED20	Q9H944	212 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	DUSP13	Q9UII6	198 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		12.55	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PPW3	197 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241		E9PQ18	207 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	PRKY	O43930	277 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	NGF	P01138	241 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	APOC1	P02654	83 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	SPARC	P09486	303 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	ACSM4	P0C7M7	580 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	EPHA2	P29317	976 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	GGTLC2	Q14390	218 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	KLHL12	Q53G59	568 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	DRAM2	Q6UX65	266 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	OTOS	Q8NHW6	89 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	EME1	Q96AY2	570 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	MNT	Q99583	582 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	TEAD3	Q99594	435 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	SYT3	Q9BQG1	590 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	ACAN	P16112	2415 aa		12.54	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241		M0R135	149 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFS8	O00217	210 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	ADRA2A	P08913	450 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	RAC2	P15153	192 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	KITLG	P21583	273 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	ERVS71-1	P61550	626 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	TMED1	Q13445	227 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	APOF	Q13790	326 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	OTP	Q5XKR4	325 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4

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