RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 C2orf80Q0P641 193 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ITGADQ13349 1161 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SNTA1Q13424 505 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SCARB2Q14108 478 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SPCS2Q15005 226 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 DEFB121Q5J5C9 76 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 FAM219BQ5XKK7 198 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SAXO2Q658L1 398 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF367Q7RTV3 350 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 NUP54Q7Z3B4 507 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 COMMD6Q7Z4G1 85 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 PRR22Q8IZ63 422 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 HS3ST5Q8IZT8 346 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 CENPSQ8N2Z9 138 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 OR10G2Q8NGC3 310 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 OR4A15Q8NGL6 344 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 OR4F5Q8NH21 305 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 CLHC1Q8NHS4 586 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 APH1BQ8WW43 257 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 GGHQ92820 318 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ITFG2Q969R8 447 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SMIM10Q96HG1 83 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 MED30Q96HR3 178 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SERINC2Q96SA4 455 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 FEVQ99581 238 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 AIF1LQ9BQI0 150 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 FUZQ9BT04 418 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ANKRD19PQ9H560 264 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 AAMDCQ9H7C9 122 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF556Q9HAH1 456 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 C3orf14Q9HBI5 128 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SLC25A19Q9HC21 320 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 UTS2RQ9UKP6 389 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ERVK-19Q9WJR5 959 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 TRAPPC4Q9Y296 219 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 CLDN16Q9Y5I7 305 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 MMP24Q9Y5R2 645 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 PEX16Q9Y5Y5 336 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PRQ8 180 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 METTL15A6NJ78 407 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 FAAHO00519 579 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ERI3O43414 337 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 XPNPEP2O43895 674 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 MITFO75030 526 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 AQP8O94778 261 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 CCNB2O95067 398 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 MFN2O95140 757 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 LGI1O95970 557 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 MT-ND2P03891 347 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 IGKV3-11P04433 115 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 IFNW1P05000 195 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 GUSBP08236 651 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 CD36P16671 472 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 NAGAP17050 411 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 RRM2P31350 389 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 BSGP35613 385 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 TGFBR2P37173 567 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF83P51522 516 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 CRISP1P54107 249 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 LIM2P55344 173 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 DSTNP60981 165 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 TGM3Q08188 693 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 DGCR6Q14129 220 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 EBPQ15125 230 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 GUSBP1Q15486 140 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM44Q2T9K0 475 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF404Q494X3 552 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 RAET1LQ5VY80 246 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SLX4IPQ5VYV7 408 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 FAM90A2PQ658T7 463 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ASPHD2Q6ICH7 369 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 VTCN1Q7Z7D3 282 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 IGFN1Q86VF2 1251 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ANKRD46Q86W74 232 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 EGFL6Q8IUX8 553 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 CLECL1Q8IZS7 167 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 PROKR2Q8NFJ6 384 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 OR4K17Q8NGC6 315 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 OR8J1Q8NGP2 316 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 CNIH3Q8TBE1 160 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SFXN5Q8TD22 340 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 TAMM41Q96BW9 452 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 TM4SF18Q96CE8 201 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF607Q96SK3 696 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 CITED1Q99966 193 aa5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms