RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 HERPUD1Q15011 391 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 METTL11BQ5VVY1 283 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 CD276Q5ZPR3 534 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 FUNDC1Q8IVP5 155 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 LRTOMTQ8WZ04 291 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 SGTBQ96EQ0 304 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 POLE4Q9NR33 117 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 SNNO75324 88 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 NPY4RP50391 375 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 ARF6P62330 175 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 COX10Q12887 443 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 SLC35E4Q6ICL7 350 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 C11orf44Q8N8P7 122 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM255BQ8WV15 326 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 ITPKCQ96DU7 683 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 COG8Q96MW5 612 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM109Q9BVC6 243 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 PCDHAC1Q9H158 963 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 KCNK9Q9NPC2 374 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 THAP1Q9NVV9 213 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 NECAP2Q9NVZ3 263 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 SGCEO43556 437 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 CD247P20963 164 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 RPL27P61353 136 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 KRT71Q3SY84 523 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 C11orf87Q6NUJ2 197 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 Q6ZTK2 550 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 LIPHQ8WWY8 451 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 RASSF4Q9H2L5 321 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 SMURF1Q9HCE7 757 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 ERVK-18Q9QC07 812 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 SIGLEC9Q9Y336 463 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXD12-201ENST00000404162 EVPLLA8MZ36 301 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 HLA-DPB1P04440 258 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 IRF2P14316 349 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 TGFBR2P37173 567 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 SCRN3Q0VDG4 424 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 MAB21L1Q13394 359 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 ALG10Q5BKT4 473 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 OTPQ5XKR4 325 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 FBXW12Q6X9E4 464 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 IGFN1Q86VF2 1251 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 BHLHE23Q8NDY6 225 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 FNDC8Q8TC99 324 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 SGCDQ92629 289 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 TOR3AQ9H497 397 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 ZNRD1Q9P1U0 126 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 FBLN5Q9UBX5 448 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 VPREB3Q9UKI3 123 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 FAM20BO75063 409 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 FCN3O75636 299 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 DBHP09172 617 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 SPDL1Q96EA4 605 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 WACQ9BTA9 647 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 FOXJ3Q9UPW0 622 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 CORO2BQ9UQ03 480 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 HIF3AQ9Y2N7 669 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 FAM96BQ9Y3D0 163 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 USH1CQ9Y6N9 552 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 COL7A1Q02388 2944 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 IQCF6A8MYZ5 107 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 FBP2O00757 339 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 FPR3P25089 353 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 GATA4P43694 442 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 CTXN1P60606 82 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 GALNT4Q8N4A0 578 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD42Q8N9B4 389 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 C11orf65Q8NCR3 313 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM239Q8WW34 195 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB9Q96C00 473 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 UFSP2Q9NUQ7 469 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM100Q9NV29 134 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC167Q9P0B6 97 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 H7C1C5 153 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 ADAM20O43506 726 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 IGF2P01344 180 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 GABRA5P31644 462 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 RBM34P42696 430 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 PRSS12P56730 875 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 WDR4P57081 412 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 LCN6P62502 163 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 VSNL1P62760 191 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 MPPED2Q15777 294 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 LYG1Q8N1E2 194 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC75AQ8NAA5 344 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 OR11L1Q8NGX0 322 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD12-201ENST00000404162 Q8TCH9 128 aa15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms