RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM120BA0PK00 339 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM47DPA6NHR8 397 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 BTNL10A8MVZ5 291 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 RDH16O75452 317 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC22A5O76082 557 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 P0C880 135 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP1.35□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF250P15622 560 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNFSF9P41273 254 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
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RNU6-552P-201ENST00000362869 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP1.35□□□□□ -2.19
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RNU6-552P-201ENST00000362869 SASS6Q6UVJ0 657 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 CASP12Q6UXS9 341 aa1.35□□□□□ -2.19
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RNU6-552P-201ENST00000362869 OR5M1Q8NGP8 315 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2A1Q8NGT9 310 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 AKR7LQ8NHP1 331 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRC29Q8WV35 223 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 TVP23CQ96ET8 276 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP1.35□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 MICU1Q9BPX6 476 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 RSG1Q9BU20 258 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 RACGAP1Q9H0H5 632 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP1.35□□□□□ -2.19
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RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP1.35□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 VANGL2Q9ULK5 521 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 HPCAL4Q9UM19 191 aa1.35□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 HEATR9A2RTY3 570 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 XKRY2A2RUG3 117 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB29O14966 203 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSPAN13O95857 204 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGLV3-25P01717 112 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMED10P49755 219 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.19
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RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP1CBP62140 327 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP1.34□□□□□ -2.19
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RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 XKR7Q5GH72 579 aa1.34□□□□□ -2.19
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RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC22A9Q8IVM8 553 aa1.34□□□□□ -2.19
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RNU6-552P-201ENST00000362869 OR5B3Q8NH48 314 aa1.34□□□□□ -2.19
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RNU6-552P-201ENST00000362869 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.19
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RNU6-552P-201ENST00000362869 OR5B12Q96R08 314 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC29A1Q99808 456 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 LZTS2Q9BRK4 669 aa1.34□□□□□ -2.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 EDA2RQ9HAV5 297 aa1.34□□□□□ -2.19
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RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa1.33□□□□□ -2.2
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RNU6-552P-201ENST00000362869 CLOCKO15516 846 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLHL41O60662 606 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CIB2O75838 187 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 H6PDO95479 791 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 SERPINA5P05154 406 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTSLP07711 333 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANXA5P08758 320 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERGP11308 486 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF24P17028 368 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 GGT1P19440 569 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 LOXP28300 417 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 RRM2P31350 389 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDH6P55285 790 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRR3P79522 188 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 C9orf135Q5VTT2 229 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADNP2Q6IQ32 1131 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM150AQ86TG1 271 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 NKAIN4Q8IVV8 208 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDH26Q8IXH8 852 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 IQCKQ8N0W5 287 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 COX18Q8N8Q8 333 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRELID2Q8N945 189 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF680Q8NEM1 530 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
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