RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 SELENOVP59797 346 aa23.04■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 ACTR3P61158 418 aa23.04■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa23.04■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa23.04■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 PITX2Q99697 317 aa23.04■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 SLC25A19Q9HC21 320 aa23.04■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa23.04■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 MTORP42345 2549 aa23.04■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 C17orf100A8MU93 164 aa23.03■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 SPARCP09486 303 aa23.03■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 SLC25A16P16260 332 aa23.03■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF23P17027 643 aa23.03■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 ANOS1P23352 680 aa23.03■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 MMP15P51511 669 aa23.03■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 PLBD1Q6P4A8 553 aa23.03■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 BPESC1Q9GZL8 116 aa23.03■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa23.03■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 KCNG2Q9UJ96 466 aa23.03■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa23.02■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 G3V2T6 193 aa23.02■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 H3BNX3 289 aa23.02■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 FMO3P31513 532 aa23.02■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 CRISP1P54107 249 aa23.02■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 ARL9Q6T311 187 aa23.02■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa23.02■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 HIPK1Q86Z02 1210 aa23.02■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 BBS1Q8NFJ9 593 aa23.02■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 UBASH3BQ8TF42 649 aa23.02■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 ATF6BQ99941 703 aa23.02■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 OR51V1Q9H2C8 321 aa23.02■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
TPGS1-201ENST00000359315 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa23.01■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 FCGR1AP12314 374 aa23.01■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 EPHA2P29317 976 aa23.01■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 NR4A2P43354 598 aa23.01■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 ENTPD1P49961 510 aa23.01■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 PSG7Q13046 419 aa23.01■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 DCXRQ7Z4W1 244 aa23.01■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 NAA40Q86UY6 237 aa23.01■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF786Q8N393 782 aa23.01■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 PARP8Q8N3A8 854 aa23.01■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 SNX33Q8WV41 574 aa23.01■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 DNAJC9Q8WXX5 260 aa23.01■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 YIPF5Q969M3 257 aa23.01■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 PIMREGQ9BSJ6 248 aa23.01■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 PTTG3PQ9NZH4 202 aa23.01■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 F5H5K5 113 aa23■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 M0R129 80 aa23■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 ACSM4P0C7M7 580 aa23■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 COL8A2P25067 703 aa23■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 CCL8P80075 99 aa23■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 GGTLC2Q14390 218 aa23■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 PCK2Q16822 640 aa23■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa23■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 CMBLQ96DG6 245 aa23■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 PKP2Q99959 881 aa23■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 OAZ3Q9UMX2 235 aa23■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa22.99■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 SAC3D1A6NKF1 404 aa22.99■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 H3BSA7 217 aa22.99■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 NDUFS8O00217 210 aa22.99■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 IGHV1-46P01743 117 aa22.99■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 HMGN1P05114 100 aa22.99■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF81P51508 661 aa22.99■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 PRSS12P56730 875 aa22.99■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 TSTQ16762 297 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 KDM4DQ6B0I6 523 aa22.99■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 CPOQ8IVL8 374 aa22.99■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 C1orf174Q8IYL3 243 aa22.99■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 MSL2Q9HCI7 577 aa22.99■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 KRT84Q9NSB2 600 aa22.99■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 TVP23BQ9NYZ1 205 aa22.99■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 GPR160Q9UJ42 338 aa22.99■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 C5orf63A6NC05 138 aa22.98■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 SPRY3O43610 288 aa22.98■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 GLCEO94923 617 aa22.98■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 GSTT1P30711 240 aa22.98■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 RIN1Q13671 783 aa22.98■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 SPRNQ5BIV9 151 aa22.98■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 COLCA1Q6ZS62 124 aa22.98■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 SPATC1Q76KD6 591 aa22.98■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 OR6N2Q8NGY6 317 aa22.98■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 ST7LQ8TDW4 575 aa22.98■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TPGS1-201ENST00000359315 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms