RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXL2Q9UKC9 423 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0B4J2E0 115 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1B0GX12 115 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM200CA6NKL6 621 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 RPS27P42677 84 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 NPY4RP50391 375 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SHEQ5VZ18 495 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SUMF2Q8NBJ7 301 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 PRRX2Q99811 253 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 C20orf85Q9H1P6 137 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SHROOM3Q8TF72 1996 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD34BA5PLL1 514 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ELK1P19419 428 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 BCKDHBP21953 392 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 NFYBP25208 207 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 OR52W1Q6IF63 320 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 PBOV1Q9GZY1 135 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 UFSP2Q9NUQ7 469 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 GPATCH2Q9NW75 528 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 BRICD5Q6PL45 260 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC22A25Q6T423 547 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 LYSMD2Q8IV50 215 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SCCPDHQ8NBX0 429 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 OR4C3Q8NH37 302 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 C17orf50Q8WW18 174 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 IL20Q9NYY1 176 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SH2D1BO14796 132 aa14.77□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 OMGP23515 440 aa14.77□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 CHATP28329 748 aa14.77□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF425Q6IV72 752 aa14.77□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 R4GN57 208 aa14.77□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD33BA6NCL7 494 aa14.77□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 CSF3P09919 207 aa14.77□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 B4GALT1P15291 398 aa14.77□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 CCR6P51684 374 aa14.77□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ELFN2Q5R3F8 820 aa14.77□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 NOXO1Q8NFA2 376 aa14.77□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 OR6K3Q8NGY3 331 aa14.77□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC6A13Q9NSD5 602 aa14.77□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB6AP20340 208 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 AKR1C1Q04828 323 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2G2Q8NGZ5 317 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ROBO4Q8WZ75 1007 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 MMP25Q9NPA2 562 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 MTCH2Q9Y6C9 303 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 PTAFRP25105 342 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 BTG1P62324 171 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNJ8Q15842 424 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 RHBDD2Q6NTF9 364 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 WFDC8Q8IUA0 241 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 REEP6Q96HR9 211 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 MCM3APO60318 1980 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 IFITM5A6NNB3 132 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 HS3ST1O14792 307 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM127O75204 238 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 TFF2Q03403 129 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 SIGLEC14Q08ET2 396 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 SSPNQ14714 243 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 CEACAM16Q2WEN9 425 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 PHLDA2Q53GA4 152 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ASPDHA6ND91 283 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 TNFSF14O43557 240 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 HBE1P02100 147 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 APOA2P02652 100 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF266Q14584 549 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 PRSS41Q7RTY9 318 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD37Q7Z713 158 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC38A9Q8NBW4 561 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 SSX3Q99909 188 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 OPA3Q9H6K4 179 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC22A13Q9Y226 551 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf196B1AJZ1 125 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ALG1L2C9J202 215 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 BHLHE40O14503 412 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 FCN2Q15485 313 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ACER2Q5QJU3 275 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms