RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 GLSO94925 669 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 UBL3O95164 117 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 ITGB2P05107 769 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 CD2P06729 351 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 WT1P19544 449 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 ANOS1P23352 680 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 KIR2DL3P43628 341 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 PLA2G7Q13093 441 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 PDSS1Q5T2R2 415 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 PLXDC2Q6UX71 529 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 RFT1Q96AA3 541 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 STEAP1Q9UHE8 339 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 FOXJ3Q9UPW0 622 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 CYTIPO60759 359 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 SLC2A1P11166 492 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 RANBP1P43487 201 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 MAP2K3P46734 347 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 RRADP55042 308 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 CLDN18P56856 261 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 PRSS45Q7RTY3 260 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 PLPP7Q8NBV4 271 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 SYNPRQ8TBG9 265 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 ABHD3Q8WU67 409 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 TRIM63Q969Q1 353 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 LYRM1O43325 122 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 CD46P15529 392 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 NR4A2P43354 598 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 ZNF84P51523 738 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 SOX8P57073 446 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 PPIAP62937 165 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 ARG2P78540 354 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 DGCR2P98153 550 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 RHOUQ7L0Q8 258 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 GLCCI1Q86VQ1 547 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 PRRX2Q99811 253 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 MRI1Q9BV20 369 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 CKLFQ9UBR5 152 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 RCE1Q9Y256 329 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 ZNF407Q9C0G0 2248 aa15.77■□□□□ 0.12
ACTB-201ENST00000331789 TM4SF5O14894 197 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 ITGA5P08648 1049 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 FSTP19883 344 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 CX3CR1P49238 355 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 ART1P52961 327 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 PITPNAQ00169 270 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 GALK2Q01415 458 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 MTFR2Q6P444 385 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 LINGO2Q7L985 606 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 LUZP2Q86TE4 346 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 OR51A2Q8NGJ7 313 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 FGGYQ96C11 551 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 ABCG5Q9H222 651 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 NIPAL2Q9H841 368 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 ZNF319Q9P2F9 582 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 A0A1B0GTI1 187 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 TFECO14948 347 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 CD3GP09693 182 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 CEACAM1P13688 526 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 ZNF708P17019 499 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 SRP9P49458 86 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 MMP15P51511 669 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 CCL11P51671 97 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 SPOCK1Q08629 439 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 MZT2BQ6NZ67 158 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 ZNF283Q8N7M2 679 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 OR51D1Q8NGF3 324 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 OR8B12Q8NGG6 310 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 ENKURQ8TC29 256 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 OR51E1Q8TCB6 317 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 HAS2Q92819 552 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 YIPF5Q969M3 257 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 SOX7Q9BT81 388 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 KCNK15Q9H427 330 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 CRLF2Q9HC73 371 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 SLC5A6Q9Y289 635 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 ETV7Q9Y603 341 aa15.76■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 DNAJC13O75165 2243 aa15.75■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 SYT7O43581 403 aa15.75■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 GRB2P62993 217 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 RAB11BQ15907 218 aa15.75■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 HYAL4Q2M3T9 481 aa15.75■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 ZNF766Q5HY98 468 aa15.75■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 IGF2-ASQ6U949 168 aa15.75■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 NAA40Q86UY6 237 aa15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms