RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 SLC25A38Q96DW6 304 aa23.7■■□□□ 1.38
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HOXD8-201ENST00000313173 CAMK2AQ9UQM7 478 aa23.7■■□□□ 1.38
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HOXD8-201ENST00000313173 GLSO94925 669 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
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HOXD8-201ENST00000313173 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD8-201ENST00000313173 HIST2H3AQ71DI3 136 aa23.65■■□□□ 1.38
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HOXD8-201ENST00000313173 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
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HOXD8-201ENST00000313173 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
HOXD8-201ENST00000313173 ARG2P78540 354 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXD8-201ENST00000313173 GLT8D1Q68CQ7 371 aa23.64■■□□□ 1.37
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HOXD8-201ENST00000313173 ZFP3Q96NJ6 502 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
HOXD8-201ENST00000313173 SYT7O43581 403 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD8-201ENST00000313173 CTSSP25774 331 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD8-201ENST00000313173 CX3CR1P49238 355 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD8-201ENST00000313173 PPIAP62937 165 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
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HOXD8-201ENST00000313173 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
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HOXD8-201ENST00000313173 UBE2J2Q8N2K1 259 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD8-201ENST00000313173 ABHD3Q8WU67 409 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM45BQ96B21 275 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD8-201ENST00000313173 HAVCR1Q96D42 359 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXD8-201ENST00000313173 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXD8-201ENST00000313173 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXD8-201ENST00000313173 MEGF11A6BM72 1044 aa23.63■■□□□ 1.37
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