RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 ZNF724A8MTY0 619 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 TMEM127O75204 238 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 KRT33AO76009 404 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 PAHP00439 452 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 IGHG3P01860 377 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 B4GALT1P15291 398 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 FSTP19883 344 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 SDHBP21912 280 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 EVX1P49640 407 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 PRKXP51817 358 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 HIST1H3AP68431 136 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 CEACAM16Q2WEN9 425 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 XKRXQ6PP77 449 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 HIST2H3AQ71DI3 136 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 LINGO2Q7L985 606 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 LRRTM1Q86UE6 522 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 MCEMP1Q8IX19 187 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 TUSC5Q8IXB3 177 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 ELMOD2Q8IZ81 293 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 ZNF671Q8TAW3 534 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 ASB5Q8WWX0 329 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 FOXB1Q99853 325 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 LINC00470Q9BZP3 86 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 CALHM2Q9HA72 323 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 GPR35Q9HC97 309 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 PARPBPQ9NWS1 579 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 CKLFQ9UBR5 152 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 MALT1Q9UDY8 824 aa9.25□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 A0A0B4J203 849 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 OR6C65A6NJZ3 312 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 P2RY10O00398 339 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 DOK2O60496 412 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 MAS1P04201 325 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 CST2P09228 141 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 ACSM4P0C7M7 580 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 FCGR2AP12318 317 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 ADRA2CP18825 462 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 ELK1P19419 428 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 TALDO1P37837 337 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 MADCAM1Q13477 382 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 IL18Q14116 193 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 TRIM16LQ309B1 348 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 ELFN2Q5R3F8 820 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 HES5Q5TA89 166 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 IGFL3Q6UXB1 125 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 DCDC5Q6ZRR9 648 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 OR8H2Q8N162 312 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 CENPSQ8N2Z9 138 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 ZNF283Q8N7M2 679 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 GDPD1Q8N9F7 314 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 LGALS14Q8TCE9 139 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 KCNJ15Q99712 375 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 PLEK2Q9NYT0 353 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 EXTL2Q9UBQ6 330 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 CLEC4AQ9UMR7 237 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 SLC5A6Q9Y289 635 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 ASPMQ8IZT6 3477 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 SPTBN2O15020 2390 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 SLC22A20A6NK97 555 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 IGHV3-9P01782 118 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 SLC2A1P11166 492 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.933e-7■■■■■ 32.7
COPS2-201ENST00000299259 DEFA1P59665 94 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 DEFA3P59666 94 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 GALK2Q01415 458 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 SCRN3Q0VDG4 424 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 RAB35Q15286 201 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 PYDC2Q56P42 97 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 TSPO2Q5TGU0 170 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 Q6ZNX1 250 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 LUZP2Q86TE4 346 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 SLC22A24Q8N4F4 322 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 MINDY2Q8NBR6 621 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 DNAAF1Q8NEP3 725 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 APH1AQ96BI3 265 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 FBXO17Q96EF6 278 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 HDHD2Q9H0R4 259 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 CYSLTR2Q9NS75 346 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 C14orf119Q9NWQ9 140 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 TAS2R4Q9NYW5 299 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 ZNF175Q9Y473 711 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 DCHS1Q96JQ0 3298 aa9.24□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 URB1O60287 2271 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa9.23□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 A0A1B0GVI7 797 aa9.23□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 ZNF587BE7ETH6 402 aa9.23□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 SYT7O43581 403 aa9.23□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 APOA1P02647 267 aa9.23□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 YES1P07947 543 aa9.23□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 IL7P13232 177 aa9.23□□□□□ -0.93
COPS2-201ENST00000299259 CTSSP25774 331 aa9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms