RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 STATHP02808 62 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 CD3DP04234 171 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 WNT1P04628 370 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 EIF1P41567 113 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 CRYBB2P43320 205 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 RAB6CQ53S08 254 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 LHX4Q969G2 390 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 RAB6CQ9H0N0 254 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 TK1P04183 234 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 NKAIN3Q8N8D7 197 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 CHST14Q8NCH0 376 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 VN1R2Q8NFZ6 395 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 OR10A7Q8NGE5 316 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM38AQ9H6F2 299 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 NR0B2Q15466 257 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 NKAIN2Q5VXU1 208 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 ACER3Q9NUN7 267 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 ASIC5Q9NY37 505 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 IFITM5A6NNB3 132 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 IL22RA1Q8N6P7 574 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 IL17FQ96PD4 163 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 Q9N2K0 584 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 DTYMKP23919 212 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 DPP4P27487 766 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 AOAHP28039 575 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 ERVFRD-1P60508 538 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 ID2Q02363 134 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 RASL12Q9NYN1 266 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 NTMQ9P121 344 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 ARRDC5A6NEK1 342 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 RAB29O14966 203 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 CHRM2P08172 466 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 VIPR2P41587 438 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 TSFMP43897 325 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 ERVK-16P61578 105 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM151BQ8IW70 566 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 HGDQ93099 445 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 STARD4Q96DR4 205 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 A6NDN8 102 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF860A6NHJ4 632 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 OR2J2O76002 312 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 DAOP14920 347 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 ADRA1AP35348 466 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 KLHDC9Q8NEP7 349 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 KLK11Q9UBX7 282 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 FXYD1O00168 92 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 CER1O95813 267 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 TIMP2P16035 220 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 CD200P41217 278 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 PDE7AQ13946 482 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 NSDHLQ15738 373 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 GUCA2BQ16661 112 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 XKR7Q5GH72 579 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 TP53INP2Q8IXH6 220 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 SPTSSAQ969W0 71 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 ARSGQ96EG1 525 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 C19orf43Q9BQ61 176 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 GP1BAP07359 652 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 SHC2P98077 582 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 VWA2Q5GFL6 755 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 DPPA3Q6W0C5 159 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 RCBTB1Q8NDN9 531 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 ASB11Q8WXH4 323 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 TBX15Q96SF7 602 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 HINT2Q9BX68 163 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 A4GNTQ9UNA3 340 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 SLC22A20A6NK97 555 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 PLA2G10O15496 165 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 BMP5P22003 454 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 GALP22466 123 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 CSNK1A1P48729 337 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 EFNA3P52797 238 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 IER5LQ5T953 404 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 NHLRC1Q6VVB1 395 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 MISPQ8IVT2 679 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 NUBPLQ8TB37 319 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 PRR14Q9BWN1 585 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF337Q9Y3M9 751 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 A0A1W2PPE2 198 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 NPBWR1P48145 328 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 ZP2Q05996 745 aa13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms