RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 PSMB6P28072 239 aa9.77□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa9.77□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF561Q8N587 486 aa9.77□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 OR4A4PQ8NGN8 299 aa9.77□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 ROBO4Q8WZ75 1007 aa9.77□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 PPP1R14AQ96A00 147 aa9.77□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 PRDM7Q9NQW5 492 aa9.77□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 CKLFQ9UBR5 152 aa9.77□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 TMED7Q9Y3B3 224 aa9.77□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 ASPMQ8IZT6 3477 aa9.77□□□□□ -0.84
CNGA3-201ENST00000272602 A0A1B0GV90 55 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 M0R296 226 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 SULT2B1O00204 365 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF217O75362 1048 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 AGR2O95994 175 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 WNT11O96014 354 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 CD63P08962 238 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 CPMP14384 443 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 GPR143P51810 404 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 NDUFA6P56556 154 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 CTXN1P60606 82 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 MICBQ29980 383 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM35AQ53FP2 167 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 ANKRD16Q6P6B7 361 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 C1orf210Q8IVY1 113 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 SHISA5Q8N114 240 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 PHYHIPQ92561 330 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 PHYHIPLQ96FC7 376 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 MRI1Q9BV20 369 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 SEC11CQ9BY50 192 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 SLC22A13Q9Y226 551 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 OR10H2O60403 315 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 YIF1AO95070 293 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 ITGA5P08648 1049 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 GRK6P43250 576 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 DNASE1L1P49184 302 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 BLKP51451 505 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 NFATC4Q14934 902 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 LCN10Q6JVE6 187 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 SYT13Q7L8C5 426 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 ZAR1Q86SH2 424 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 MISPQ8IVT2 679 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 SKA3Q8IX90 412 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 SPEM1Q8N4L4 309 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 GAL3ST4Q96RP7 486 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 FRRS1LQ9P0K9 344 aa9.77□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 PRR32B1ATL7 298 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 DCTN6O00399 190 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF44P15621 663 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 MAOAP21397 527 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 SLC2A5P22732 501 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 TMPPEQ6ZT21 453 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 GVQW1Q8N7I0 195 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF565Q8N9K5 539 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 CLEC1AQ8NC01 280 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 CCDC74AQ96AQ1 378 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 CMBLQ96DG6 245 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 MEGF10Q96KG7 1140 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 AICDAQ9GZX7 198 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 UFSP2Q9NUQ7 469 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 A0A087WV62 115 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 C11orf98E9PRG8 122 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 CLN5O75503 358 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 STK17BO94768 372 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 HOXB5P09067 269 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 GNALP38405 381 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 RAB28P51157 221 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 DUSP8Q13202 625 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 OR5T3Q8NGG3 340 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 OR2A1Q8NGT9 310 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 PIK3IP1Q96FE7 263 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 HDAC8Q9BY41 377 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 MMP26Q9NRE1 261 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 HAO2Q9NYQ3 351 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 KIF26BQ2KJY2 2108 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 THADAQ6YHU6 1953 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 SCGB1D2O95969 90 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 HPGDP15428 266 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 BIKQ13323 160 aa9.76□□□□□ -0.85
CNGA3-201ENST00000272602 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms