RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL15Q96M94 604 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 NMNAT3Q96T66 252 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 G6PC3Q9BUM1 346 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 MTFP1Q9UDX5 166 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM77I1YAP6 450 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP2K6P52564 334 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 TMUB2Q71RG4 321 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC29A4Q7RTT9 530 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 MDGA2Q7Z553 956 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 ZAR1Q86SH2 424 aa23.5■■□□□ 1.35
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF440Q8IYI8 595 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF614Q8N883 585 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF441Q8N8Z8 693 aa23.5■■□□□ 1.35
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF417Q8TAU3 575 aa23.5■■□□□ 1.35
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CAPNS1-201ENST00000246533 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 C12orf4Q9NQ89 552 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 OPN4Q9UHM6 478 aa23.5■■□□□ 1.35
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CAPNS1-201ENST00000246533 OR1C1Q15619 314 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 NUBPLQ8TB37 319 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 ALG12Q9BV10 488 aa23.49■■□□□ 1.35
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CAPNS1-201ENST00000246533 DCTDP32321 178 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
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CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM81Q6P7N7 255 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINA12Q8IW75 414 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 PRR22Q8IZ63 422 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5L2Q8NGL0 311 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 OR6N1Q8NGY5 312 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 NPIPB9F8W1W9 429 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 GABRA1P14867 456 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 SSR4P51571 173 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 PSG6Q00889 435 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT77Q7Z794 578 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRTM1Q86UE6 522 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM156Q8N614 296 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 MDS2Q8NDY4 140 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 LIPHQ8WWY8 451 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 OIT3Q8WWZ8 545 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa23.48■■□□□ 1.35
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CAPNS1-201ENST00000246533 ARSKQ6UWY0 536 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
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CAPNS1-201ENST00000246533 STEAP1Q9UHE8 339 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 OR6C76A6NM76 312 aa23.47■■□□□ 1.35
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CAPNS1-201ENST00000246533 CYB561P49447 251 aa23.47■■□□□ 1.35
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
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CAPNS1-201ENST00000246533 OR6M1Q8NGM8 313 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00052Q96N35 136 aa23.47■■□□□ 1.35
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CAPNS1-201ENST00000246533 EMC4Q5J8M3 183 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 GSG1LQ6UXU4 331 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 TFAP2EQ6VUC0 442 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 PDZD9Q8IXQ8 264 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNRF4Q8WWF5 429 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 VSTM2LQ96N03 204 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 COMMD4Q9H0A8 199 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 LDAHQ9H6V9 325 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 ABI3Q9P2A4 366 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa23.45■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM212A6NML5 194 aa23.45■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa23.45■■□□□ 1.35
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF254O75437 659 aa23.45■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 UPK3AO75631 287 aa23.45■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 RPA2P15927 270 aa23.45■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD16Q6P6B7 361 aa23.45■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 NPSR1Q6W5P4 371 aa23.45■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2AK2Q8NG84 335 aa23.45■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4N2Q8NGD1 307 aa23.45■■□□□ 1.35
CAPNS1-201ENST00000246533 PHYHO14832 338 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 CT45A8P0DMV1 189 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 CT45A9P0DMV2 189 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 PNMTP11086 282 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 CLDN12P56749 244 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPNS1-201ENST00000246533 EGR3Q06889 387 aa23.45■■□□□ 1.34
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