RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 FRMD1Q8N878 549 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 CTSFQ9UBX1 484 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 R4GMQ9 66 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 LRP4O75096 1905 aa20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM235A6NFC5 223 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC85CA6NKD9 419 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 GPANK1O95872 356 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 ACTL6AO96019 429 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 BTG2P78543 158 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 SGCBQ16585 318 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 KIAA0895LQ68EN5 471 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 CORO6Q6QEF8 472 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 GATSQ8NAP1 163 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 GLYATL2Q8WU03 294 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 PATE1Q8WXA2 126 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 LRP12Q9Y561 859 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 A0A0G2JNG1 304 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 C10orf142B7Z368 130 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 KIR2DS3K7RE56 304 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 EFSO43281 561 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 SPARCP09486 303 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 CCR5P51681 352 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 KIR2DS5Q14953 304 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM71Q6P5X7 295 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 FJX1Q86VR8 437 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 PARGQ86W56 976 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 JAGN1Q8N5M9 183 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 OR13C3Q8NGS6 347 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 OR52N5Q8NH56 324 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 GPBAR1Q8TDU6 330 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM46BQ96A09 425 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 MRGPRFQ96AM1 343 aa20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54-201ENST00000215941 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM25EA8MYX2 175 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 I3L1I5 382 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 IGHMP01871 453 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 CLPSP04118 112 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 PGAM2P15259 253 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC6A9P48067 706 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 MOGAT2Q3SYC2 334 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 AVPI1Q5T686 147 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 CD163Q86VB7 1156 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 ABHD6Q9BV23 337 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 TXNIPQ9H3M7 391 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 TMED7Q9Y3B3 224 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 DCDC2BA2VCK2 349 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 PRSS44E7EML9 344 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 RAB27BO00194 218 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 UTS2O95399 124 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 CXCR1P25024 350 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 MEOX2P50222 304 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 PJVKQ0ZLH3 352 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 NKPD1Q17RQ9 610 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM244Q5VVB8 128 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 OR4S1Q8NGB4 309 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 PAQR8Q8TEZ7 354 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 UQCC1Q9NVA1 299 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 A0A0B4J2A0 478 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 NSA2O95478 260 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 IGLV3-19P01714 112 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 LYL1P12980 280 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 ABOP16442 354 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF542PQ5EBM4 170 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 FBLN5Q9UBX5 448 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 SHPKQ9UHJ6 478 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 CSAG2Q9Y5P2 127 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 HCRTR1O43613 425 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC16A7O60669 478 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 PAX6P26367 422 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 CRABP1P29762 137 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 AVPR2P30518 371 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 DEGS2Q6QHC5 323 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 CBLN2Q8IUK8 224 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 DCUN1D4Q92564 292 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 TLNRD1Q9H1K6 362 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM60AQ9NP50 221 aa20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54-201ENST00000215941 FITM1A5D6W6 292 aa20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms