RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638603.1

SCARB2-211, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SCARB2, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-211ENST00000638603 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 OR1S1Q8NH92 325 aa7.36□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 TMEM41AQ96HV5 264 aa7.36□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 GPER1Q99527 375 aa7.36□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 AIFM2Q9BRQ8 373 aa7.36□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 RTN4RQ9BZR6 473 aa7.36□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.36□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 FANCMQ8IYD8 2048 aa7.36□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 TXNDC12O95881 172 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 GIMD1P0DJR0 217 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 MGMTP16455 207 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 CAPZBP47756 277 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 SCAND1P57086 179 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 UBXN2BQ14CS0 331 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 ELOCQ15369 112 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 MOGAT2Q3SYC2 334 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 KIAA0895LQ68EN5 471 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 FJX1Q86VR8 437 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 GVQW1Q8N7I0 195 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 OR6K3Q8NGY3 331 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 SPACA5Q96QH8 159 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 PHB2Q99623 299 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 PRRT1Q99946 306 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 NUDT22Q9BRQ3 303 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 NUDT9Q9BW91 350 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 SELENOIQ9C0D9 397 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 S1PR5Q9H228 398 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 KCNAB3O43448 404 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 SYT7O43581 403 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 AQP8O94778 261 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 RPA2P15927 270 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 CSRP2Q16527 193 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 SGCBQ16585 318 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 DNM1P34Q6PK57 102 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 COX15Q7KZN9 410 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 TMEM229BQ8NBD8 167 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 OR13C9Q8NGT0 318 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 IFI6P09912 130 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 ATP1B3P54709 279 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 HYAL1Q12794 435 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 MPPED2Q15777 294 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 AKIRIN2Q53H80 203 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 DMRTC1Q5HYR2 192 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 AWAT2Q6E213 333 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 FOXRED2Q8IWF2 684 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 OR52N5Q8NH56 324 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 RPS4Y2Q8TD47 263 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 EMC6Q9BV81 110 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 SLC6A15Q9H2J7 730 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 OR2S2Q9NQN1 319 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 MED29Q9NX70 200 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 A8MVM7 634 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 FADS1O60427 444 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 LMX1BO60663 402 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 STK17BO94768 372 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 BGLAPP02818 100 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 IGHV4-34P06331 123 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 HLA-DOBP13765 273 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 ZNF20P17024 532 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 TLE3Q04726 772 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 ZNF273Q14593 569 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 OVCH2Q7RTZ1 564 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 BIVMQ86UB2 503 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 SHARPINQ9H0F6 387 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.35□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 DCHS1Q96JQ0 3298 aa7.34□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 FRG2CA6NGY1 282 aa7.34□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 TOR1AO14656 332 aa7.34□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 MT-ATP6P00846 226 aa7.34□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 PMP2P02689 132 aa7.34□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 GNB3P16520 340 aa7.34□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 PRKACAP17612 351 aa7.34□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 FBLP22087 321 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 FOXL2P58012 376 aa7.34□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 IKZF1Q13422 519 aa7.34□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 PPP1R1AQ13522 171 aa7.34□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 ARFRP1Q13795 201 aa7.34□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 MEF2DQ14814 521 aa7.34□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 TMEM244Q5VVB8 128 aa7.34□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.34□□□□□ -1.23
SCARB2-211ENST00000638603 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.6 ms