RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629179.1

PNKP-223, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 4

Gene PNKP, Length 811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-223	ENST00000629179	GIF	P27352	417 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	GCH1	P30793	250 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	MAGEB1	P43366	347 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	CORO6	Q6QEF8	472 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	GIPC3	Q8TF64	312 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	DDO	Q99489	341 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	POFUT1	Q9H488	388 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	GPR160	Q9UJ42	338 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	DYSF	O75923	2080 aa		12.14	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	OR6C6	A6NF89	314 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	GNGT2	O14610	69 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	ICMT	O60725	284 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	ABHD16A	O95870	558 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	HLA-DQA2	P01906	255 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	DBH	P09172	617 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	GSTM3	P21266	225 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	PYCR1	P32322	319 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	ARHGDIA	P52565	204 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	CCL8	P80075	99 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	TEK	Q02763	1124 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	RIN1	Q13671	783 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	MOG	Q16653	247 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	ARL9	Q6T311	187 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	LNX2	Q8N448	690 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	SNX33	Q8WV41	574 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	FEV	Q99581	238 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	STARD10	Q9Y365	291 aa		12.13	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	LRP5L	A4QPB2	252 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	FKBP6	O75344	327 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	HIST1H3A	P68431	136 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	GJC3	Q8NFK1	279 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	RDH5	Q92781	318 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	YIPF5	Q969M3	257 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		12.12	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	TVP23A	A6NH52	213 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	SPRY3	O43610	288 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	LILRA1	O75019	489 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF23	P17027	643 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	PRKACG	P22612	351 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF81	P51508	661 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	MMP15	P51511	669 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	CBX1	P83916	185 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	COX10	Q12887	443 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	PSG7	Q13046	419 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	GK3P	Q14409	553 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	TRIP10	Q15642	601 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	SLC36A3	Q495N2	470 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179		H3BSA7	217 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	CDC14B	O60729	498 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PNKP-223	ENST00000629179	E2F6	O75461	281 aa		12.1	□□□□□ -0.47

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