RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620854.4

NEDD9-216, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NEDD9, Length 4,086 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9-216ENST00000620854 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 TMEM235A6NFC5 223 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 ABCD4O14678 606 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 WDPCPO95876 746 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 SPP1P10451 314 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 ERGP11308 486 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 AWAT2Q6E213 333 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 BEND4Q6ZU67 534 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 Q7L0L9 218 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 TMEM200AQ86VY9 491 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 SFTPA2Q8IWL1 248 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 SYS1Q8N2H4 156 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 FRMD1Q8N878 549 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 OR4C3Q8NH37 302 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 PATE1Q8WXA2 126 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 TMEM234Q8WY98 164 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 CLCC1Q96S66 551 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 LRIT1Q9P2V4 623 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 DAPP1Q9UN19 280 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 A0A0B4J2E0 115 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 A0A1B0GX12 115 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 RFPL4AA6NLU0 287 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 H0Y8X5 98 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 XRCC3O43542 346 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF254O75437 659 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 CTAG2O75638 210 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 LYPD3O95274 346 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 JMJD7P0C870 316 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 PGCP20142 388 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 CD27P26842 260 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 GLYATL3Q5SZD4 288 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 FCRL6Q6DN72 434 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 OR52W1Q6IF63 320 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 Q6ZS52 159 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 BIVMQ86UB2 503 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 NAXDQ8IW45 347 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 ACBD4Q8NC06 268 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 OR1E3Q8WZA6 343 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 THRSPQ92748 146 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 CMBLQ96DG6 245 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 AMELYQ99218 206 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 IFT22Q9H7X7 185 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF304Q9HCX3 659 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 TBC1D29Q9UFV1 150 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 TNFRSF10CO14798 259 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 SYT7O43581 403 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 OR2T1O43869 369 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 GPRIN2O60269 458 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 TMEM225BP0DP42 221 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 IL13RA1P78552 427 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 DHRS2Q13268 280 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 NR0B2Q15466 257 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 AGBL4Q5VU57 503 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 MDGA2Q7Z553 956 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 SPEM1Q8N4L4 309 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 SMRP1Q8NCR6 262 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 ELP5Q8TE02 316 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 EDAQ92838 391 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 COX14Q96I36 57 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 MOGAT1Q96PD6 335 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 PTGES2Q9H7Z7 377 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 RASL12Q9NYN1 266 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 HAO2Q9NYQ3 351 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 DTX4Q9Y2E6 619 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 FRMPD3Q5JV73 1810 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 UNC13CQ8NB66 2214 aa6.29□□□□□ -1.4
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