RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601665.5

NUP62-223, Transcript of nucleoporin 62, human

TSL 5

Gene NUP62, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUP62-223	ENST00000601665	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	PTP4A1	Q93096	173 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	HAVCR1	Q96D42	359 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	RBP7	Q96R05	134 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	SORT1	Q99523	831 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	SEPHS2	Q99611	448 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	POFUT1	Q9H488	388 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	TOR3A	Q9H497	397 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	PNPO	Q9NVS9	261 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	SDHD	O14521	159 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	BIRC5	O15392	142 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	FSTL3	O95633	263 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	MPIG6B	O95866	241 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	ETV4	P43268	484 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	UGT2B15	P54855	530 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	STX3	Q13277	289 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	SCARB2	Q14108	478 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	KCNJ8	Q15842	424 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	SPERT	Q8NA61	448 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	SMYD1	Q8NB12	490 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	C10orf82	Q8WW14	230 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	MPP4	Q96JB8	637 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	STARD10	Q9Y365	291 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665		F5H5P2	479 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	DOK2	O60496	412 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	PAH	P00439	452 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	MMP9	P14780	707 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	RAC2	P15153	192 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	MSR1	P21757	451 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	BGN	P21810	368 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	AQP2	P41181	271 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	ERF	P50548	548 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	ARF6	P62330	175 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	OR2T2	Q6IF00	324 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	C11orf88	Q6PI97	169 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	OR8G5	Q8NG78	346 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	PPA2	Q9H2U2	334 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	COL7A1	Q02388	2944 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NUP62-223	ENST00000601665	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	TYROBP	O43914	113 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	COX5B	P10606	129 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	FUT1	P19526	365 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	PSMB10	P40306	273 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	NPTX1	Q15818	432 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	SYT9	Q86SS6	491 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	OR5R1	Q8NH85	324 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	FNDC8	Q8TC99	324 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	GTF2H4	Q92759	462 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	PHF21A	Q96BD5	680 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	ITPKC	Q96DU7	683 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	ALG12	Q9BV10	488 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	HAO1	Q9UJM8	370 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	HDAC3	O15379	428 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	ADAM20	O43506	726 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	SGCE	O43556	437 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	CD247	P20963	164 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NUP62-223	ENST00000601665	COX10	Q12887	443 aa		10.13	□□□□□ -0.79

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